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北京百泰派克生物科技有限公司
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糖蛋白結(jié)構(gòu)能否用圓二色性(CD)分析?適

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糖蛋白結(jié)構(gòu)能否用圓二色性(CD)分析?適用性與局限全面解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù): 糖蛋白廣泛分布于生命系統(tǒng)的多個(gè)層面,參與細(xì)胞識(shí)別、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、免疫調(diào)節(jié)等關(guān)鍵過(guò)程。其結(jié)構(gòu)復(fù)雜性主要體現(xiàn)在糖鏈的多樣性和修飾位點(diǎn)的分布,這一特點(diǎn)也使得糖蛋白的結(jié)構(gòu)研究具有相當(dāng)高的挑戰(zhàn)性。在結(jié)構(gòu)表征方法中,圓二色性(Circular Dichroism, CD)光譜因其快速、非破壞性和操作簡(jiǎn)便的特點(diǎn),被廣泛用于dànbáizhì的

糖蛋白結(jié)構(gòu)能否用圓二色性(CD)分析?適用性與局限全面解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

糖蛋白廣泛分布于生命系統(tǒng)的多個(gè)層面,參與細(xì)胞識(shí)別、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、免疫調(diào)節(jié)等關(guān)鍵過(guò)程。其結(jié)構(gòu)復(fù)雜性主要體現(xiàn)在糖鏈的多樣性和修飾位點(diǎn)的分布,這一特點(diǎn)也使得糖蛋白的結(jié)構(gòu)研究具有相當(dāng)高的挑戰(zhàn)性。在結(jié)構(gòu)表征方法中,圓二色性(Circular Dichroism, CD)光譜因其快速、非破壞性和操作簡(jiǎn)便的特點(diǎn),被廣泛用于dànbáizhì的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析。


CD光譜簡(jiǎn)述

CD光譜是基于手性分子對(duì)左右圓偏振光吸收差異的光譜技術(shù)。在蛋白研究中,遠(yuǎn)紫外區(qū)CD(190–250nm)主要反映蛋白主鏈二級(jí)結(jié)構(gòu)構(gòu)象,例如α-螺旋和β-折疊。相比X射線晶體學(xué)、冷凍電鏡等高分辨率手段,CD具有實(shí)驗(yàn)周期短、樣品需求少、分析環(huán)境接近天然狀態(tài)等優(yōu)勢(shì),適用于快速評(píng)估構(gòu)象變化與熱穩(wěn)定性。然而,CD光譜本質(zhì)上反映的是整分子平均結(jié)構(gòu)信息,信號(hào)受到構(gòu)象異質(zhì)性、溶液條件等因素影響較大,且不能提供原子級(jí)或結(jié)構(gòu)域級(jí)別的解析。


適用性一:糖鏈不直接產(chǎn)生干擾信號(hào),主鏈構(gòu)象仍可監(jiān)測(cè)

糖鏈本身并不在CD信號(hào)響應(yīng)區(qū)(尤其是遠(yuǎn)紫外區(qū))產(chǎn)生顯著吸收,因此在理論上并不會(huì)直接遮蔽蛋白主鏈的CD信號(hào)。這意味著,即使存在糖基化修飾,CD依然可以反映出dànbáizhì骨架的主要二級(jí)結(jié)構(gòu)組成。特別是當(dāng)糖鏈修飾程度較低、分布較為分散,或位于結(jié)構(gòu)表面不影響折疊核心時(shí),CD所得光譜與非糖基化蛋白類似,分析結(jié)果可供研究者參考。在實(shí)際研究中,CD常被用于評(píng)估糖基化是否顯著改變蛋白主鏈的折疊狀態(tài),從而判斷修飾對(duì)構(gòu)象穩(wěn)定性是否具有調(diào)節(jié)作用。這類用途突出CD在趨勢(shì)判斷中的功能價(jià)值。


適用性二:結(jié)構(gòu)快速篩查、構(gòu)象對(duì)比場(chǎng)景中具實(shí)用價(jià)值

CD技術(shù)由于靈敏度高、響應(yīng)快、對(duì)樣品濃度要求低,非常適合用于以下糖蛋白研究情境:


  • 對(duì)比不同表達(dá)體系產(chǎn)物的整體構(gòu)象差異;

  • 評(píng)估糖基化對(duì)蛋白熱穩(wěn)定性的影響;

  • 初步判斷糖蛋白是否處于天然折疊狀態(tài);

  • 在突變或修飾前后監(jiān)測(cè)構(gòu)象變化趨勢(shì)。


這些應(yīng)用均不依賴原子級(jí)信息,而更注重結(jié)構(gòu)輪廓變化,因此CD可以作為初篩工具,為后續(xù)高分辨率結(jié)構(gòu)研究提供參考依據(jù)。


局限性一:糖鏈引起背景吸收,信噪比下降

盡管糖鏈不直接產(chǎn)生強(qiáng)CD信號(hào),但其在短波長(zhǎng)區(qū)域可能引發(fā)背景吸收,尤其是在含有多個(gè)糖基位點(diǎn)或大分子量聚糖修飾時(shí)。這種背景干擾可能導(dǎo)致190–200nm波段信號(hào)質(zhì)量下降,影響數(shù)據(jù)穩(wěn)定性和可靠性。此外,CD信號(hào)強(qiáng)度對(duì)樣品濃度和光程高度敏感,當(dāng)糖鏈數(shù)量較多時(shí),為避免吸收過(guò)強(qiáng)而降低樣品濃度,可能進(jìn)一步削弱可檢測(cè)的主鏈信號(hào),限制分析結(jié)果的分辨率。


局限性二:構(gòu)象柔性增加,信號(hào)平均效應(yīng)增強(qiáng)

糖鏈具有高度柔性,常處于多個(gè)構(gòu)象之間動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)換,這種結(jié)構(gòu)異質(zhì)性在CD光譜中表現(xiàn)為信號(hào)模糊或特征峰不明顯。當(dāng)糖鏈占分子質(zhì)量較大比例或修飾密度較高時(shí),整個(gè)蛋白的構(gòu)象一致性降低,CD光譜反映的是一個(gè)平均化的、動(dòng)態(tài)的結(jié)構(gòu)輪廓,較難解析出具體的二級(jí)結(jié)構(gòu)比例。這種平均效應(yīng)尤其影響CD擬合算法對(duì)α-螺旋和β-折疊等結(jié)構(gòu)類型的定量評(píng)估,導(dǎo)致分析結(jié)果偏離真實(shí)構(gòu)象狀態(tài)。


局限性三:空間分辨率低,無(wú)法定位結(jié)構(gòu)變化來(lái)源

CD光譜提供的是整體結(jié)構(gòu)特征的“投影",無(wú)法對(duì)不同結(jié)構(gòu)域、修飾位點(diǎn)或糖鏈本身的構(gòu)象變化進(jìn)行區(qū)分。例如,如果CD光譜顯示某一構(gòu)象變化,無(wú)法明確這一變化是源于糖鏈的添加、核心結(jié)構(gòu)域的不穩(wěn)定,還是溶液條件的改變。因此,當(dāng)研究目標(biāo)涉及特定位點(diǎn)的構(gòu)象動(dòng)態(tài),或者需分析糖鏈與蛋白主鏈之間的局部構(gòu)象耦合關(guān)系時(shí),CD無(wú)法勝任此類精細(xì)化解析任務(wù)。


適用與局限的平衡:如何合理使用CD技術(shù)?

CD在糖蛋白研究中既有其可操作空間,也存在清晰的應(yīng)用邊界:


  • 適用的,是整體結(jié)構(gòu)趨勢(shì)分析:如主鏈構(gòu)象是否改變、熱穩(wěn)定性是否下降、不同表達(dá)產(chǎn)物是否一致。

  • 局限的,是細(xì)節(jié)解析和修飾定位問(wèn)題:如糖鏈對(duì)局部結(jié)構(gòu)影響、糖鏈自身構(gòu)象、不同修飾位點(diǎn)對(duì)結(jié)構(gòu)的獨(dú)立貢獻(xiàn)。


CD應(yīng)被視為一種支持性工具,適合早期篩查或輔助判斷,而非用于替代高分辨率結(jié)構(gòu)方法。在多技術(shù)聯(lián)用的策略中,CD可以與質(zhì)譜、冷凍電鏡、NMR等手段形成有效互補(bǔ),提升整體結(jié)構(gòu)研究效率。


圓二色性光譜作為經(jīng)典的構(gòu)象分析工具,在糖蛋白研究中仍有可用價(jià)值,尤其在對(duì)趨勢(shì)、差異、穩(wěn)定性等維度進(jìn)行評(píng)估時(shí)能夠發(fā)揮有效作用。但必須明確,其分析深度和精度有限,不能獨(dú)立完成復(fù)雜結(jié)構(gòu)問(wèn)題的解析任務(wù)。如您正面臨糖蛋白結(jié)構(gòu)表征、構(gòu)象分析或方法選擇的技術(shù)難題,歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技,獲取zhuānyè建議與定制化解決方案,助力科研進(jìn)展更進(jìn)一步。


百泰派克生物科技特色項(xiàng)目


一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù),包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù),對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題??稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

糖蛋白結(jié)構(gòu)能否用圓二色性(CD)分析?適




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,軟件審計(jì)追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù);

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



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