蛋白測序策略選擇：何時用Edman測序而非質譜？檢測技術服務詳情介紹

在dànbáizhì研究中，測序技術的選擇往往決定了實驗能否成功。雖然質譜（Mass Spectrometry, MS）已成為主流的蛋白測序工具，但Edman降解（Edman degradation）仍然在某些場景中bùkětìdài。那么，何時選擇Edman測序而非質譜？這不僅關乎實驗設計效率，也關系到結果的可解釋性與應用價值。本文將從原理、優勢對比、適用場景等角度，深入解析這兩種策略的異同，幫助科研人員做出更jīngzhǔn的技術選擇。

一、兩種測序原理的根本差異

1、Edman降解：經典但依賴于N端

Edman降解是基于化學反應逐步切割N端氨基酸并進行鑒定的方式。每次循環可鑒定一個氨基酸，適用于N端游離且較短的肽段，理論上可達到20–30個氨基酸的測序深度。

（1）優點：高準確率、序列信息直接、可讀性強

（2）局限：對N端封閉蛋白無能為力、無法解析修飾、不適用于復雜混合物

2、質譜測序：速度與通量的代表

質譜測序依賴肽段離子在氣相中的碎裂模式，結合數據庫搜索或de novo算法推測序列，是目前高通量蛋白組學的核心技術。常用平臺包括Orbitrap、TOF等，配合LC-MS/MS系統可實現對千級以上蛋白的并行分析。

（1）優點：靈敏度高、通量大、適配修飾分析

（2）局限：序列推斷需數據庫依賴，de novo算法在低質量數據時準確性下降；蛋白起始點信息不總是清晰

二、如何根據實驗目標選擇測序方法？

1、明確研究目標：需要“哪一段"的序列？

（1）只需N端起始序列確認：Edman測序優先 適用于新蛋白表達產物的確認、成熟蛋白N端剪切位點驗證等

（2）需全序列、翻譯后修飾信息、復雜樣本中識別：質譜測序為主選

百泰派克生物科技建議：在構建表達系統時，若引入標簽（如His、Flag等）易造成N端封閉，影響Edman反應活性，應提前設計保留N端游離。

2、樣品純度：是否足夠支持Edman測序？

Edman測序需高純度蛋白樣本（>90%）且量不少于1–5 µg，并要求蛋白在PVDF膜上固定、轉印完整。

如果樣品雜蛋白干擾嚴重，Edman測序結果容易混淆；質譜則具有更好的抗雜能力，可通過預分離提高特異性識別。

3、蛋白是否有修飾或變體存在？

質譜可同時識別磷酸化、乙酰化、糖基化等翻譯后修飾，以及突變、剪切變異等分子異構形式。Edman則無法應對這些復雜修飾。

三、哪些典型應用場景更適合Edman測序？

1、單一純化蛋白的N端驗證

例如：驗證重組蛋白表達正確性、檢測成熟蛋白是否經信號肽剪切。

2、生物藥一致性分析（如抗體藥物）

在抗體藥物開發中，N端氨基酸序列的直接讀取有助于確認藥品一致性、加工穩定性和法規合規性。

3、無數據庫匹配參考的全新蛋白研究

在一些新物種、微生物株中，質譜由于缺少數據庫支撐，de novo推斷誤差大；Edman提供的jīngquèN端序列可以輔助構建參考蛋白庫。

四、實際操作中，是否可以聯合使用？

當然可以。Edman測序與質譜測序是互補而非互斥的技術。聯合策略示例：先進行Edman測序獲取N端序列，再用質譜確認其余部分并解析修飾信息。這種方式能zuì大化獲取結構信息，也更利于后續功能研究或抗體設計。

百泰派克生物科技的技術建議與服務優勢

在百泰派克生物科技，我們提供包括：

• 高純度蛋白SDS-PAGE后PVDF膜轉印+Edman降解

• Orbitrap平臺下的高分辨率LC-MS/MS蛋白測序

• 蛋白翻譯后修飾分析、標簽識別、de novo序列拼接

通過科學的策略整合，我們幫助多個客戶實現從蛋白表達驗證→結構解析→功能鑒定的高效轉化，提升研發效率與數據可信度。Edman測序并未過時，它在某些精細結構分析中依然dújù優勢。而質譜的高通量特性則為大規模組學研究提供了基礎。zuì關鍵的，是根據實驗目的、樣本狀態和預算合理選擇測序方式，甚至融合使用。如您在蛋白測序策略選擇方面仍有疑問，歡迎隨時聯系百泰派克生物科技獲取定制化技術支持，我們期待為您的科研項目保駕護航。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白zhìzǔxué分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術先進，填補技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

蛋白測序策略選擇：何時用Edman測序而非質譜？檢測技術服務詳情介紹