當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術服務>>蛋白分析>> 為什么Edman降解仍然重要?探索其不可
價格 | 詢價 |
---|
在質譜技術主導dànbáizhì組學的時代,Edman降解似乎成了“過去式"。但事實并非如此。作為一種經典且jīngzhǔn的N端dànbáizhì測序方法,Edman降解在多個關鍵場景中依然有著bùkětìdài的價值,尤其是在dànbáizhì結構驗證、藥物質量控制以及非模式生物的研究中。本文將深入解析Edman降解的原理與優勢,剖析其在現代科研與生物醫藥中的dútè應用場景,并探討如何與質譜技術形成互補,發揮zuì大效能。
一、什么是Edman降解?
Edman降解是一種用于確定dànbáizhì或多肽N端氨基酸序列的化學方法,由瑞典生物化學家Pehr Edman于1950年開發。其基本原理包括三步:
1、N端氨基酸與苯異硫氰酸(PITC)反應;
2、形成環狀衍生物并在酸性條件下斷裂,釋放出shǒugè氨基酸(以PTH衍生物形式);
3、使用HPLC對PTH-氨基酸進行鑒定。
??這種逐步“讀取"N端序列的方式,zuì多可測定約30個氨基酸,在高純度樣品中具有jígāo的準確率。
二、為什么Edman降解仍然bùkěhuòquē?
盡管質譜具有高通量和高靈敏度等優勢,但在以下幾個關鍵應用中,Edman降解仍展現出其他方法難以替代的dútè價值:
1、N端驗證:確保蛋白翻譯起始位點準確
在表達與純化dànbáizhì時,科學家常常需要確認是否從正確的起始密碼子開始翻譯,是否存在N端延伸或截斷。這在設計功能蛋白、重組抗體、疫苗時尤為關鍵。
質譜在識別復雜翻譯后修飾或N端微小變化時可能受限;
而Edman降解能直接讀取N端序列本身,無需依賴數據庫,結論更具確定性。
??典型應用:確認抗體重鏈/輕鏈是否有額外的起始氨基酸,判斷表達系統中信號肽是否被準確切除。
2、蛋白藥物研發與生產:構建穩定可靠的質量體系
在生物藥開發過程中,dànbáizhì結構一致性是質量控制的核心環節。無論是藥物發現階段的初始篩選,還是后期的中試放大與生產批次穩定性評估,Nduāncèxù都是重要的驗證手段。
Edman降解可用于確認dànbáizhì起始序列是否符合設計;
幫助研發人員判斷表達系統是否導致非預期的氨基酸修飾或切除。
3、凝膠條帶鑒定:驗證目標蛋白身份,排查雜帶干擾
在SDS-PAGE或2D凝膠中,即使某條蛋白條帶看似純凈,其真實組成仍可能包含多種蛋白。直接將條帶切下并進行Edman測序,可以快速判斷其主成分是否為目標蛋白。
不同于質譜常見的“混合肽段分析",Edman可線性讀取蛋白N端序列,對單一主帶蛋白尤為jīngzhǔn;
在抗原制備、蛋白純度驗證等實驗中,提供直觀可追溯的結構信息。
4、非模式生物研究:無需數據庫,獲取原始序列信息
質譜依賴數據庫進行肽段匹配,而對于尚無完整基因組信息的非模式物種(如某些植物、微生物或海洋生物),這種方法存在明顯局限。
Edman降解則以化學方式直接讀取N端序列,不依賴任何背景信息;
是非模式物種中新蛋白發現與初步結構鑒定的重要手段。
三、Edman降解的局限性及zuìjiā應用策略
雖然Edman降解具有dútè優勢,但它也存在一些技術限制:
因此,科研和工業界更傾向于采用“Edman + 質譜"雙策略:
用Edman降解jīngquè定義dànbáizhìN端序列;
用質譜補足中段與C端序列,實現全序列確認。
Edman降解依然是dànbáizhì測序中zuì具確定性的一環,在對結果精度要求jígāo的場景下,它不僅是對質譜結果的重要補充,更是某些關鍵節點上的“wéiyī選擇"。百泰派克生物科技致力于提供高質量的基于Edman降解的蛋白N端序列分析服務,幫助科研與產業客戶提升數據可信度,加快研發進程。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術先進,填補技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!
請輸入賬號
請輸入密碼
請輸驗證碼
以上信息由企業自行提供,信息內容的真實性、準確性和合法性由相關企業負責,化工儀器網對此不承擔任何保證責任。
溫馨提示:為規避購買風險,建議您在購買產品前務必確認供應商資質及產品質量。