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單細胞蛋白質組學質譜分析旨在解析單個細胞內的蛋白質組成及其動態變化。傳統蛋白質組學方法通常需要大量細胞樣本,而單細胞蛋白質組學質譜分析則突破了這一限制,它能夠在單細胞分辨率下分析蛋白質的表達水平、修飾狀態及相互作用。這為理解細胞異質性、生物過程調控及疾病機制提供了qiánsuǒwèiyǒu的研究視角。單細胞蛋白質組學質譜分析在多個研究領域具有應用價值。例如,在腫瘤研究中,腫瘤細胞群體往往具有高度異質性,某些亞群可能對治療產生耐藥性。通過單細胞蛋白質組學分析,研究人員能夠識別這些亞群的特征蛋白,從而優化jīngzhǔn治療策略。此外,在免疫學研究中,該技術可用于解析免疫細胞的動態變化,揭示特定免疫亞群在疾病發生過程中的作用。在神經科學、干細胞生物學和發育生物學等領域,單細胞蛋白質組學質譜分析也為探索細胞分化、命運決定和信號通路調控提供了關鍵數據支持。盡管單細胞蛋白質組學質譜分析發展迅速,但仍然面臨多方面的挑戰。在樣本制備方面,單細胞樣本的蛋白含量極低,如何在zuì小損耗的情況下進行蛋白提取和富集仍是難點;細胞裂解和蛋白質提取的效率影響數據質量,優化裂解和降解控制策略至關重要。在數據獲取與解析方面,單細胞蛋白組數據通常具有較大的隨機性,如何提高定量的穩定性和可重復性是一個核心問題;多組學數據整合(如與單細胞轉錄組學結合)仍需優化方法以避免數據異質性帶來的偏差。
一、單細胞蛋白質組學質譜分析常用的技術
由于單個細胞的蛋白質含量極低(通常在皮克摩爾或飛克摩爾水平),單細胞蛋白質組學質譜分析依賴于一系列高靈敏度技術以確保數據的準確性和重復性。
1、單細胞分離與制備
(1)流式細胞分選(FACS) 和 微流控技術 被廣泛用于高效分選單個細胞。微流控平臺能夠jīngquè操控微量樣本,實現單細胞級別的蛋白提取。
(2)微量蛋白富集與裂解 采用優化的裂解緩沖液和表面富集策略(如納米顆粒捕獲)提高蛋白質回收率。
2、高靈敏度質譜檢測
(1)超高分辨率質譜(HRMS):如Orbitrap和TOF-MS能夠實現飛克摩爾級別的蛋白檢測,提高數據的定量精度。
(2)數據獨立采集(DIA-MS):避免數據缺失,提高單細胞蛋白質組的覆蓋度。
(3)增強型串聯質譜(TMT-SPS-MS3):結合化學標記提高多重樣本定量能力,增強單細胞信號檢測能力。
3、生物信息學分析
(1)單細胞層級的數據降噪算法可減少數據變異,提高蛋白質鑒定的準確性。
(2)機器學習與人工智能 在數據分析中發揮作用,可用于預測蛋白質網絡、識別關鍵生物學模式,并實現跨樣本整合分析。
二、單細胞蛋白質組學質譜分析的突破
近年來,研究人員通過以下技術突破提升了單細胞蛋白質組學質譜分析的分析能力:
1、納米尺度質譜進樣:減少樣本損耗,提高檢測靈敏度。
2、深度學習輔助數據解析:提高蛋白質鑒定的可靠性和定量精度。
3、空間單細胞蛋白組學:結合成像質譜技術,直接在組織切片上解析蛋白表達,提供空間定位信息。
百泰派克生物科技致力于為科研人員提供高質量的單細胞蛋白質組學分析服務。無論是癌癥、免疫學還是神經科學領域,我們的服務均能助力科研人員揭示細胞異質性、優化治療方案,推動生命科學前沿探索。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對蛋白質序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對蛋白質的氨基酸組成分析,N端測序,C端測序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質,提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白質組學、靶向蛋白質組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種蛋白質標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從蛋白質、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
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