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Precellys研磨儀:助力水源細菌污染物的快速定量檢測

閱讀:991        發布時間:2020-11-11
 

人類日常接觸到的水源,例如海洋、湖泊、河流等,可能已經受到了微生物的污染。歐盟EU和美國環境保護機構EPA都已經將腸球菌Enterococcus spp與大腸桿菌E.coli的含量作為水質檢測的指標。本篇應用中,法國Blue DNA Companion公司根據EU和EPA的條例,收集了水源之后,推出了一個總時間小于3小時,多參數檢測這兩種微生物的方法。這種快速定量檢測分析是基于RT-PCR這種針對活細菌的分析方法。其中在細菌裂解中,用到的是法國Bertin公司的高性能研磨器Precellys Evolution,該方法已經被世界著名水務公司Suez Environment蘇伊士環境集團認證。

實驗材料

 

GenoSPYD過濾試劑盒(Blue DNA Compaion公司,法國);

 

Precellys Evolution組織研磨器(Bertin公司,法國);

 

MagSPYD自動化核酸提取平臺(Blue DNA Compaion公司,法國);

 

MIC PCR儀;

 

GenoSPYD針對Enterococcus spp與E.coli的q-PCR定量試劑盒。

 

 

 

實驗程序

 

1.微生物樣品收集:每個樣品被0.45μm的濾膜過濾。之后將濾膜裝到GenoSPYD裂解管中,并加入1.5mlGenoSPYD細菌裂解緩沖液;

 

2.將裂解管放入到Precellys Evolution組織研磨器中,研磨程序為轉速6500rpm、3個循環、每個循環研磨45s、循環間歇30s;

 

3.RNA提取:包含RNA的溶菌產物使用GenoSPYD RNA提取試劑盒進行純化,可在MagSPYD自動化核酸提取平臺進行;

 

4.在MIC PCR儀上進行qRT-PCR的檢測。

 

 

 

實驗結果

 

圖1為對Enterococcus spp檢測的qRT-PCR放大曲線結果,

表1為水中腸球菌Enterococcus spp與大腸桿菌E.coli的LOQ(定量檢測限)和LOD(檢測下限)的結果。

 

 

結論

 

GenoSPYD自動化產品解決方法配合Precellys組織研磨器可以在3小時內快速檢測和定量活微生物樣本中一些特定如大腸桿菌、腸球菌、葡萄球菌、假單胞菌的RNA含量等。此方法的水質檢測指標可以達到100CFU,同時也被世界著名水務公司Suez Environment蘇伊士環境集團認證。

 

細菌樣本裂解程度直接決定了之后提取RNA的效率,Precellys Evolution研磨儀具備高性能、高效率、安全等特點,同時有冷卻裝置Cryolys Evolution,可使整個研磨過程的溫度準確維持在0-10℃,加配無RNA酶的研磨kit,輕松實現穩態RNA的提取,助力水源中細菌污染物的快速定量檢測,值得信賴!

 

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