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Precellys研磨儀：助力胃部微生物群的研究
閱讀：891 發布時間：2020-11-11
目前高通量測序可以有效評估胃部微生物群的含量，但在臨床上很難實現。研究人員希望可以尋找一個在血清層面試驗的方法，來評估胃部微生物群的含量。
韓國漢陽大學醫學院近日在PLOS ONE雜志上發表文章，研究通過幽門螺桿菌抗體和胃蛋白酶原的檢測來預測胃部微生物群的含量。其中在胃部黏膜組織DNA提取中，使用法國Bertin的Precellys研磨器，良好的研磨效果助力接下來的測序及微生物群的分析。
研究人員評估了兩種相對含量與胃癌相關的細菌（亞硝酸細菌和IV型分泌系統蛋白基因產生菌T4SS）與血清標記物（幽門螺桿菌抗體HP，胃蛋白酶原PG）的關系。
DNA提取方法：樣品：胃部研磨組織；Precellys24研磨儀；研磨條件為轉速6500rpm，研磨90s，研磨珠為0.1mm的鋯珠；提取的DNA樣品用無DNA酶水溶，之后用DNA純化試劑盒（QIAGEN）純化，-80℃保存。
經過16S rRNA基因測序分析微生物含量的變化，結果如圖1、圖2所示：
圖一中A-D四張結果分別為不同濃度胃蛋白酶原PG與兩種細菌的關系圖，其中隨著PG濃度水平下降，細菌的含量上升；
圖2中A-D四個結果分別不同濃度胃蛋白酶原PG與兩種細菌的關系，其中分別有HP抗體陽性、HP抗體陰性以及未確定的三組細菌含量的比較；HP抗體陰性的兩種細菌含量明顯高于HP抗體陽性；同時隨著PG含量的下降，細菌含量上升。
法國Bertin公司研磨器Precellys因其高效的研磨效率，安全的研磨性能，可以有效助力胃部或腸道微生物的研究。此外，與Precellys搭配的Cryolys制冷系統可以快速降溫，保證在研磨的同時準確控制研磨腔室溫度穩定在0-10℃，為RNA和蛋白質的提取保駕護航。