轉錄組是某個物種或者特定細胞類型產生的所有RNA，可從整體水平研究基因功能以及基因結構，揭示特定生物學過程以及疾病發生過程中的分子機理，廣泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發等領域。同時，還能發現未知轉錄本和稀有轉錄本，精確地識別可變剪切位點以及cSNP（編碼序列單核苷酸多態性），提供轉錄組信息。

轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針，即可對任意物種進行檢測，提供更精確的數據，更高的檢測通量以及更廣泛的檢測范圍，是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具。

技術優勢：

?  檢測應用范圍廣：可用于任意已知基因組序列物種，高于6個數量級的動態檢測范圍，能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本；

?  分析可靠性高：可進行全基因組mRNA分析,同時能夠檢測未知基因,發現新的轉錄本,并精確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR區域；

?  單堿基分辨率：能夠檢測到細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本。

實驗策略：

全基因組RNA→RNA片段化處理→反轉錄合成cDNA→DNA測序接頭連接→PCR擴增文庫→深度測序→Base Calling→RNA序列信息

分析內容：

注：個性化分析、多組學關聯分析請聯系對接銷售或技術支持

送樣要求：

經典案例

水稻根系響應氧化石墨烯納米片的應激反應與恢復模式

Qixing Zhou, and Xiangang Hu Systemic stress and recovery patterns of rice roots inresponse to graphene oxidenanosheets Environmental Science & Technology(2017),20 (1).

1、背景

隨著社會的發展,納米材料在生產應用中所占比重越來越大,特別是2D工程納米材料氧化石墨烯(GO),已經廣泛應用生物學,醫學,化學和環境等領域:工程納米材料GO的潛在風險引起了社會的關注,目前的研究中對于對納米粒子的生物應激反應,而與壓力恢復相關的信息在很大程度上是未知的;轉錄組學的研究可以提供更深入、詳細的分析信息便于了解生物改變的機制。

2、方法

利用RNA-Seq測序技術,分析水稻根系響應氧化石墨烯納米片的應激反應與恢復模式。

3、結論

對比研究的結果顯示,GO影響水稻基因的轉錄表達,進而影響了水稻的生長發育,而水稻根通過多種代謝途徑以及酶活性調節對GO的影響做出應對。

不同狀態下小鼠胚胎干細胞的甲基化修飾比較

參考文獻：

①     DOI:10.1021/acs.est.6b05591