自動進樣器是計算機自動控制定量閥，按預先編制的進樣操作程序工作。取樣、進樣、復位和管路清洗全部按預定程序自動進行，一次課進行幾十至上百個樣品的分析。自動進樣的樣品量可連續調節，進樣重復性好，適合做大量樣品分析，節省人力，可實現自動化操作。一般自動進樣器包括：進樣閥、定量環、進樣針頭、樣品瓶和支架等。樣品放在支架上的樣品瓶內，轉動支架或移動針讓小瓶對準針頭，下降針頭或升高小瓶使針刺入瓶中吸取樣品入轉移管，轉動進樣閥使樣品進入色譜柱分析。

   進樣閥也是六通閥，老式自動進樣器，轉子由壓縮空氣驅動。現在一般采用電機帶動轉子，而不像手動進樣器有手柄與轉子相連。轉子可根據需要旋轉一定的角度與定子中的各種通路接通。進樣周期由計時器控制，促動器給出信號轉動閥到進樣位置。無固定體積的定量環，由注射器提供位置決定樣品量，或經過位移裝置裝樣。有的自動進樣器裝有大容量的定量環，用*裝液法和反沖技術保證樣品的完整性，即使此阿勇部分裝液法，結果也比手動進樣。

   樣品托架放樣品瓶用，帶動小瓶在進樣針頭底下移動。每次進樣后針頭又對準下一個樣品瓶，準備下一次進樣，多數自動進樣后小瓶仍留在托加上，也有些是樣品被抽空后小瓶掉進廢物箱內。