菌落總數主要指的是在一定條件下檢樣所生長出來的一種細菌菌落總數。可根據我國標準且在需氧37℃培養48小時等情況下，它其實就是在普通營養瓊脂平板上所生長出來的細菌菌落總數，但如果條件金不過沒有滿足其生理要求，那就很難繁殖生長。當然我們要注意的是，菌落總數并不是實際中所有的細菌總數，它不能區分其中細菌的種類，可以被叫做雜菌數，需氧菌數等。

菌落總數它除了是判斷食物是否被污染的指標，它還是用于檢測水質的重要指標。比較常用于醫療廢水在線監測項目中。

那請問水中含有的菌落總數超標會帶來什么危害呢？可能會引起嘔吐、腹瀉等不良反應，直接危害到了人體的健康問題（如：腸道疾病等）。但在此要和大家強調的是，菌落總數和致病菌存在本質的區別，是一種包含關系。菌落總數中包含有致病菌和有益菌。但是對人體有害的是里面的致病菌，這個病菌它會破壞腸道中原本正常的菌落環境，有一部分可能在腸道里面就會被消滅掉，而一部分會留在體內可能會引起對身體器官的損傷，而有益菌包括酸奶中常被提起的乳酸菌等。所以菌落總數超標就意味著指致病菌超標的機會變大，從而增加人體健康的危害的可能性。

檢驗菌落總數的方法及檢測其指標所用到的儀器。菌落總數的測定操作步驟如下：樣品稀釋-傾注平皿-培養48h-計數報告。檢測水中菌落總數含量所用的儀器叫做“水質菌落總數在線檢測儀”。