完成ABI 7500實時熒光定量PCR(qPCR)實驗后,下一步的關鍵步驟包括數據分析、結果驗證和實驗記錄整理。以下是詳細的后續操作指南:
一、ABI 7500數據分析
ABI 7500軟件會自動生成擴增曲線、熔解曲線(SYBR Green法)和Ct值等數據,需進行以下分析:
1、擴增曲線檢查:確保所有樣本的擴增曲線呈典型的S形,指數期明顯,平臺期穩定。異常的擴增曲線(如無擴增、非特異性擴增)需排查原因。
2、熔解曲線分析(SYBR Green法):單一尖銳峰表明特異性擴增,多峰或寬峰可能提示引物二聚體或非特異性產物。
3、Ct值提取:用于定量分析,軟件可自動計算,但需手動調整閾值(通常設在指數擴增期)以提高準確性。
標準曲線評估(絕對定量):檢查擴增效率(90%-110%)、R2值(≥0.98)及線性范圍。
二、結果驗證
1、重復實驗:若個別樣本數據異常(如Ct值偏差大),需重復實驗。建議整板重做以確保可比性,避免僅重做部分孔導致批次誤差。
2、陰性/陽性對照確認:確保陰性對照無擴增,陽性對照Ct值在預期范圍內。
3、引物優化:若熔解曲線異常(如黃三角警告),可能需重新設計引物或優化退火溫度。
三、數據導出與報告生成
1、導出數據:軟件支持導出Ct值、熒光數據等,格式可為Excel或文本文件。
2、相對定量計算(如2?ΔΔCt法):需內參基因校正,確保樣本間歸一化。
3、結果可視化:繪制柱狀圖、熱圖等展示基因表達差異或病原體載量。
四、實驗記錄與儀器維護
1、記錄實驗參數:包括程序設置、試劑批次、樣本信息等,便于追溯。
2、儀器維護:清潔樣品槽,檢查光源壽命(鹵鎢燈約2000小時),定期校準。
3、數據備份:建議使用光盤或加密存儲,避免U盤直接拷貝(部分實驗室規定)。
五、常見問題處理:
1、蒸發問題:更換高質量PCR管或增大反應體系(如30 μL)。
2、氣泡干擾:上機前瞬離心去除。
相關產品
免責聲明
- 凡本網注明“來源:化工儀器網”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網絡有限公司-化工儀器網合法擁有版權或有權使用的作品,未經本網授權不得轉載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經本網授權使用作品的,應在授權范圍內使用,并注明“來源:化工儀器網”。違反上述聲明者,本網將追究其相關法律責任。
- 本網轉載并注明自其他來源(非化工儀器網)的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網贊同其觀點和對其真實性負責,不承擔此類作品侵權行為的直接責任及連帶責任。其他媒體、網站或個人從本網轉載時,必須保留本網注明的作品第一來源,并自負版權等法律責任。
- 如涉及作品內容、版權等問題,請在作品發表之日起一周內與本網聯系,否則視為放棄相關權利。