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siRNA轉染標準操作流程

來源:北京百奧創新科技有限公司   2025年07月16日 11:34  

以下是經過優化的 siRNA轉染標準操作流程,整合了關鍵參數優化與避坑指南,適用于絕大多數哺乳動物細胞系(貼壁/懸浮),分為 實驗設計、操作步驟、質控要點三部分:

一、實驗設計關鍵點(轉染前必看)

要素

推薦方案

避坑提示

siRNA濃度

終濃度10-50nM(預實驗梯度測試)

100nM易致脫靶效應

細胞密度

貼壁細胞:30-50%匯合度
懸浮細胞:2-5×10?/mL

過密毒性;過低效率

轉染試劑

Lipofectamine™ RNAiMAX(通用)
jetPRIME®(原代/難轉細胞)

避免含血清培養基稀釋試劑

對照設置

- 陰性對照:Scrambled siRNA
- 陽性對照:GAPDH siRNA
- 空白對照:僅轉染試劑

缺一不可!












二、標準操作流程(以24孔板為例)

 Day 0:細胞鋪板

1. 消化細胞 用wanquan培養基 調整密度 每孔接種 0.5mL(貼壁細胞數:5-8×10?;懸浮細胞數:2×10?)  

2. 37℃培養箱放置 16-24h(目標:轉染時匯合度≈40%)  

關鍵細節:  

- siRNA工作液濃度 = 儲存濃度×30(例:20μM儲存液工作液終濃度≈33nM)  

- 轉染試劑用量參考說明書(RNAiMAX通常 試劑:siRNA體積比=1:1)  

 Day 2:換液與檢測  

1. 轉染后 6h 更換wanquan培養基(高毒性細胞如原代神經元需4h內換液)  

2. 繼續培養 24-72h(基因沉默峰值時間需預實驗確定)  

 三、質控關鍵步驟(決定成敗!)

 1. 轉染效率驗證(必做)

- 方案1:轉染 FAM標記siRNA → 24h后熒光顯微鏡觀察(效率>80%合格)  

- 方案2:共轉染 EGFP質粒 計算綠色細胞占比(成本低但間接)  

 2. 沉默效果檢測

 3. 細胞毒性評估

- MTT法:轉染后24h檢測,存活率應>85%  

- 形態觀察:懸浮細胞聚團、貼壁細胞空泡化提示毒性過強  

 四、高頻問題解決方案

問題

原因

優化方案

效率低

siRNA降解/試劑失效

新解凍siRNA;更換轉染試劑批次

細胞死亡率高

復合物局部濃度過高

轉染前混勻培養基;懸浮細胞用旋轉培養法

沉默效果不穩定

基因半衰期長

延長檢測至72h;轉染兩次(間隔24h

脫靶效應

siRNA種子區匹配非靶基因

更換siRNA序列;使用化學修飾siRNA(如Stealth™

五、特殊細胞優化方案

1. 原代細胞:  

   - 轉染試劑:選 DharmaFECT™ Primary jetPRIME®  

   - 方案:轉染前饑餓處理2h(無血清培養基)復合物孵育時間縮短至5min  

2. 懸浮細胞:  

   - 試劑:Neofect™ DNA/RNA Transfection Reagent  

   - 步驟:離心收集細胞 重懸于復合物 → 24孔板每孔接種500μL(密度5×10?/mL)  

3. 難轉細胞(如神經元):  

   - 專用試劑:NeuroFect™(佐劑提高穿透性)  

   - 轉染后不換液 直接補等體積wanquan培養基  

六、試劑耗材推薦表

類型

推薦產品

適用場景

通用轉染試劑

Lipofectamine™ RNAiMAX

293T/HeLa等常見細胞

難轉細胞試劑

jetPRIME®

原代/干細胞/懸浮細胞

陽性對照siRNA

Silencer™ GAPDH siRNA

體系驗證

陰性對照

AllStars Neg. siRNA

排除非特異效應

> 數據標準:合格實驗需滿足——轉染效率>80% + 沉默效率>70% + 細胞存活>85%

避雷總結:  

1. 勿用含抗生素或血清的培養基稀釋復合物(滅活試劑)  

2. 轉染后換液時間寧早勿晚(超8h毒性飆升)  

3. 凍存siRNA避免反復凍融>3次(分裝儲存-80℃)  

按照此流程操作,可穩定獲得可重復的基因沉默數據!

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