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AFA-TUBE 是一款專門設(shè)計的聚合物容器，設(shè)計用于使用 truSHEAR 對樣品體積范圍為 10 至 20 µl 的 DNA 進行剪切。它提供板和條帶，可用于提高 NGS 工作流程中自動化平臺的周轉(zhuǎn)時間和吞吐量。這種新格式可以與加熱塊、磁鐵和熱循環(huán)儀兼容。板和條帶均包含用于樣品跟蹤的 RFID，專門與 Covaris 儀器一起使用。
96 AFA-TUBE TPX 板
Covaris 工程聚合物板可處理 8 至 96 個樣品，體積范圍為 10 至 50 µl。啟用 RFID 樣本跟蹤。
8 AFA-TUBE TPX 條
Covaris 工程聚合物條可處理多達 8 個樣品，體積范圍為 10 至 50 µl。啟用 RFID 樣本跟蹤。
AFA-TUBE 的特點和優(yōu)點
| 特征 | 益處 |
| 單個容器中的多個過程（例如剪切、非接觸式混合、裂解） | 工作流程簡化 |
| 用于等溫控制的工程聚合物 | 無熱致偏差或樣品損壞 |
| 基于 RFID 的樣品板跟蹤 | 樣品監(jiān)管鏈和多板、批量處理 |
| 使用 AFA-energetics® 實現(xiàn)均勻分布的空化 | 處理速度更快 |
| 標(biāo)準(zhǔn)實驗室器具 SBS 板格式設(shè)計 | 與大多數(shù)液體處理機兼容 |
| 無纖維激光蝕刻塑料 | 易于自動化 |
AFA-TUBE NGS 工作流程
使用 AFA-TUBE 獲得高精度且可重復(fù)的結(jié)果
圖 2：LE220-Plus，樣品體積為 10 µl。結(jié)果顯示，96 AFA-TUBE TPX 板的預(yù)期目標(biāo)尺寸為 150 和 350 bp，每個重復(fù) 24 個，尺寸分布緊密。
從全血中提取 HMW gDNA
圖 3 ：使用高分子量 (>20 Kb) 提取方案在 Covaris truPOP ® Buffer中提取的 gDNA（30 μl 全血）的大小分布圖。在掃描模式下，96 個樣本的處理時間為 6 分鐘。
gDNA 片段的窄尺寸分布
圖 4：使用兩種不同的格式和密封選項，在 LE220-plus 上剪切后使用片段分析儀對 DNA 進行分析。顯示了 8 AFA-TUBE TPX 條和 96 AFA-TUBE 板的 175 bp 和 350 bp 10 µl 的數(shù)據(jù)。結(jié)果顯示所有三種配置均具有較高的重現(xiàn)性和準(zhǔn)確性。
直接從全血中進行高度可重復(fù)的 DNA 片段化
圖 5：圖表顯示了高度可重復(fù)的 DNA 片段化譜（30 μl 全血）和低變異系數(shù)。 DNA 片段大小模式介于 1 和 1.3 kb 之間。通過調(diào)整 AFA 條件（未顯示）可以實現(xiàn)剪切至 NGS 兼容的片段大小分布（150 至 500 bp）。通過調(diào)整提取緩沖液條件（例如 Covaris 的 truPOP 緩沖液）可以提取高分子量 DNA (40 kb)。對于 96 AFA-TUBE TPX 板，每列處理時間為 30 秒。
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