原位雜交實驗步驟

一質粒制備

1質粒的轉化和擴增

1.1制備XL1-Blue感受態細菌

1． 取400uL XL1-Blue菌種加入到含200ml LB培養基的錐形瓶中，37 ℃、100

rpm培養4h，離心，倒置，以冰冷的0.1 mol／L CaCl_2重懸細菌，冰浴30 min，

離心，棄上清，倒置，再加4ml（含15％甘油）冰冷的CaCl2重懸細菌，分裝（200 μ／tube），-80 ℃保存。

2． 轉化：在冰浴中將1管XL1-Blue感受態菌解凍，將濃度為2ng／μ1的質粒DNA4μ1加入到8Oμ1感受態菌中。

3． 輕輕搖勻，冰浴30 min。

4．42 ℃熱激9O秒，然后迅速冰浴2 min。

5． 加入LB培養液（無氨芐青霉素）0.8ml，在37 ℃，100轉／min水浴孵育60 min。

6．取200μl菌液鋪于瓊脂板上（涂有X-Gal（20mg／ml）-IPTG（200mg／ml）的

LB-氨芐青霉素50 mg／ml,1μl／ml培養基），待菌液全部被吸收后，倒置平板于37 ℃培養12-16h。

1.2鑒定和挑選含重組質粒的菌落

1． 用無菌牙簽挑取單菌落，接種到10 ml含氨芐青霉素的LB培養液的離心管中，于37 ℃，200轉／分培養2h，取1 ml之一Eppendorf離心管，加50μl10mmol／L EDTA（pH 8.0）。

2． 加入50μl新配置的0.2mol／L NaOH、0.5％SDS、20％蔗糖溶液后，振蕩3O秒。

 3． 在70 ℃溫育5 min，然后冷卻到室溫。

4． 加1.5μ14mol／L KCl和0.5μ1含0.4％溴酚蘭染液，振蕩3O秒后，冰浴5min。

5． 12000g，4 ℃離以 3 min，以除去細菌碎片。

6． 制備1％的瓊脂糖凝膠（含EB0.5μg／ml），取50μl上清液加入到樣品孔中，其中一孔加入中等分子量DNA Marker。恒壓50V，進行電泳。

7． 當溴酚蘭遷移到凝膠全長的2／3-3／4時，停止電泳，在紫外燈下檢查質粒DNA分于量的大小是否與轉入質粒相符。

1.3質粒的擴增和純化

1． 用無菌牙簽分別挑取單個白色菌落移入含30ml LB-氨芐青霉素（50μg／ml）培養液的聚丙烯管中，于37 ℃，200轉／分培養3h。

2． 將菌液轉入含70 ml LB-氨芐青霉素培養液的250ml錐形瓶中，37 ℃，200

轉／分培養過夜（12-16h），細菌渾濁。

3. 菌液中加入氯霉素液（34mg溶于lml乙醇，100ml菌液加入0.5ml氯霉素

溶液，終濃度為170 μ／ml）。37 ℃，200轉／分培養12-16h。

4. 將培養的細菌倒入50ml的離心管中，6000rpm，4 ℃離,th,15 min，沉淀細菌。

5. 棄凈上清夜，用2ml預冷的溶液I，懸浮菌體沉淀，劇烈振蕩，于室溫靜置5 min

6. 加入新配制的溶液II 4ml，快速用手晃動10秒，顛倒數次后，于室溫靜置10 min。

7. 加入預冷的溶液III 3ml，溫和振蕩l0秒，于冰上靜置10 min，出現白色絮狀沉淀。

8． 6000rpm，4 ℃離心15 min，保留上清。

9． 將上清（若帶細菌殘片，則再次離心）移入另一50ml的離心管中，加入O.6

倍體積的異丙醇混勻，于室溫靜置10 min。（或-20 ℃4h，或4 ℃過夜，可

便核酸沉淀）

10.12000 rpm，4 ℃離心15 min，回收核酸。小心棄去上清，倒置離心管使殘

兼上清液流盡。

11．于室溫用70％的乙醇洗滌沉淀物和管壁，室溫12000 rpm離心，15 min，

充分棄去乙醇，于室溫將離心管倒置在紙巾上，使zui后殘余的痕量乙醇揮發殆盡。

12．用500μl TE（pH8.0）溶解核酸沉淀，轉移至1.5 ml Eppendorf管中。

13．加入用冰預冷的5mol／L的LiCl溶液600μl，充分混勻。12000 rpm，4 ℃離

心15 min，以沉淀高分子量的RNA。

14.將上清轉移到另一1.5 ml Eppendorf管中，加等量異丙醇，充分混勻，于室

溫靜置10min。

15.12000 rpm,4 ℃離心15 min，回收核酸。小心棄去上清，倒置離心管使殘

余上清液流盡。

16．于室溫用70％的乙醇洗滌沉淀物和管壁，室溫12000 rpm離心，15 min，

充分棄去乙醇，于室溫將離心管倒置在紙巾上，使zui后殘余的痕量乙醇揮發殆盡。

17.400μl含無DNA酶的RNA酶（20μg/ml）的TE緩沖液（pH8.0）溶解沉

淀，將溶液轉移到另－1.5 ml Eppendorf管中，室溫放置1.5ml Eppendorf

管中30min。

18．加入400μl 13％（v／v）的PEG 8000-NaCl（1.6 mol／L），混勻，4 ℃ 12000

rpm離心5 min以回收質粒DNA，棄去上清。

19．加入400μl TE緩沖液（pH 8.O）溶解沉淀，再分別用等體積的Tris飽和酚、

酚：氯仿：異戊醇（25：24：1）、和氯仿各抽提一次。

20．將水相（上清）移入另一1.5ml Eppendorf管中，加入O.1體積（約50μ13M

的醋酸鈉（pH 5.2）和2倍體積（大約1 ml）的無水乙醇，充分混勻后于4

℃放置30 min。

21．于4 ℃ 12000 rpm離心5 min回收沉淀的質粒DNA。盡可能棄去上清，敞

開管口，置工作臺上使殘留的痕量乙醇蒸發殆盡。

22．加入400 μl處于4 ℃的70％乙醇，稍加振蕩，漂洗沉淀，4 ℃ 12000 rpm離

心2 min。

23．吸去上清，室溫敞開管口，直到乙醇*揮發。

24．用100μl TE緩沖液（pH 8.0）溶解沉淀。

25．取4μl溶液1：100稀釋后，測定其OD260、OD280，以確定質粒DNA的

純度和濃度（OD260／OD280>1.8。OD260／OD280對DNA而言其值大約為

1.8，高于2.0則可能有RNA污染，低于1.8則有蛋白質污染。；DNA濃度

=OD260 X 0.05 X稀釋倍數（μg／μl）。

26．質粒DNA溶液于-20 ℃保存待用。

二、cRNA探針的標記

1． 將質粒DNA，用相應的限制性內切酶線性化，通過瓊脂糖凝膠電泳以確保

*線性化。

2． 線性化后的DNA按“質粒的純化”步驟19-24進行純化，作為cRNA探針

標記的模板，用相應的RNA聚合酶合成地高辛標記的反義和正義RNA探

針。

3． 進行體外轉錄，步驟如下：

4． 在冰上將各試劑加入一1.5 ml無RNA酶的Eppendorf管中。

DEPC處理的三蒸水8μl

質粒DNA模板 0.05μg／μl

1μl

10 x NTP地高辛標記混合物 1 x

2μl

0.1 M DTT溶液 10 mM

2μl

5 x轉錄緩沖液 1 x

4μl

RNAse抑制劑 2U／μl

1μl

RNA聚合酶 2U/μl

2μl

反應體系總體積 20μl

5． 加入上述各試劑后，混勻，簡短離心后在37 ℃孵育2h。

6． 加入2μl無RNA酶的DNA酶I（10U／μ1），37 ℃孵育15 min降解模板DNA。

7． 加入0.2M EDTA（pH 8.0）溶液2μl終止反應。

8． 加入2.5μl的4 M Licl和7.5μl冷的無水乙醇，混勻，-20 ℃放置2h。

9． 12000g下離以 15 min，棄上清，小心地用50 μl冷的70％乙醇洗滌沉淀。

1O．室溫下稍干燥，溶于100μ1 DEPC處理過的三蒸水中，混勻分裝，-20 ℃下

保持備用。

三、原位雜交

3.1冰凍切片與雜交前預處理

1． 將子宮樣品從-80 ℃取出，用OCT包埋，在-23 ℃（切片機腔體溫度）平衡

至少30 min。將包埋好的樣品固定在樣品頭上，切10μm厚的連續組織

切片，平鋪于涂有多聚賴氨酸（1mg／m1）的玻片上（玻片預先經180 ℃干

烤6小時），保存于-70 ℃冰柜備用。

2． 冰凍切片經室溫干燥10 min后，在4％的多聚甲醛-PBS（pH 7.4）固定lO

min。

3． 活躍的DEPC-PBS（未高壓的0.1％DEPC-1XPBS溶液）洗2次，每次5 min。

4． 在0.2M的鹽酸作用中作用10 min后，重復步驟4）。

5． 在切片上滴加蛋白酶K（0.1μg／m1），37 ℃孵育15 min，重復步驟4）。

6． 經0.1M TEA（三乙醇胺）作用5min后，再在新配制的0.25％AA／0.1M TEA

（乙酸酐／三乙醇胺，pH 8.0）中乙酰化10 min。

（在大多數實驗中，步驟4，5，6省略）

7． 5 x SSC中平衡15 min。

3.2雜交

8． 在脫水后的玻片上滴加預雜交液（約100 μl／玻片），置于放有濕盒液（50％

甲酰胺v／v；0.3 M NaCl；1Mm EDTA；10 mM Tris-Cl，pH 8.O）的濕盒中，

55～58 ℃下的烘箱中預雜交2 h。

9． 甩掉預雜交液，地高辛標記的反義或正義cRNA探針（濃度1-2ng／μl）經

70 ℃變性1O分鐘，置冰上1 min，玻片上滴加預雜交液（約60μl／玻片），

覆蓋parafilm膜，放濕盒中在48～58 ℃下雜交18-30 h。

3.3雜交后處理

1O．取出玻片，小心去掉Parafilm膜，甩掉雜交液，用52 ℃預熱的5×SSC洗

30 min。

11．在無DNA的RNA酶A（20μg／ml）溶液中37 ℃下孵育30 min。

12．分別依次用52 ℃預熱的2 X SSC，1 X SSC和O.1 X SSC洗2次，每次30 min。

3.4雜交信號檢測

13．在緩沖液A（0.1M Tris-HC 1 pH 7.5，0.15M NaC1）中平衡5min。

14．在玻片上滴加堿性磷酸酶的抗地高辛抗體（1：500～1:2000稀釋于含0.5％

阻斷液的緩沖液A中），室溫反應2h。

15．用緩沖液A洗2次，每次15 min。

16．在緩沖液B（0.1M Tris-HCl；0.1M NaCl；0.05M MgCl_2，pH 9.5）中平衡5

min。

17．硝基四氮唑藍（NBT）和5-溴-4-氯-3-吲哚氧磷酸鹽（BCIP）溶于緩沖液B

中，每ml緩沖液B含有4.5μ1 NBT和3.5μ1 BCIP。在玻片上滴加混合染

液在濕盒中顯色過夜。

18．充分顯色后，用EDTA（1 mM EDTA，pH 8.0）洗15 min終止反應。

19．在95％乙醇中洗l h以除去非特異的背景。

20．用蒸餾水洗15 min除去可能存在的結晶體。

21．脫水、透明，用中性樹膠封片。

22．充分干燥后在顯微鏡下觀察、照相。