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固相萃取是利用選擇性吸附與選擇性洗脫的液相色譜法分離原理。較常用的方法是使液體樣品溶液通過吸附劑，保留其中被測物質，再選用適當強度溶劑沖去雜質，然后用少量溶劑迅速洗脫被測物質，從而達到快速分離凈化與濃縮的目的。也可選擇性吸附干擾雜質，而讓被測物質流出;或同時吸附雜質和被測物質，再使用合適的溶劑選擇性洗脫被測物質。采用選擇性吸附、選擇性洗脫的方式對樣品進行富集、分離、凈化，是一種包括液相和固相物理萃取過程;也可以將其近似地看作一種簡單的色譜過程。較常用的方法是使液體樣品溶液通過吸附劑，保留其中被測物質，再選用適當強度溶劑沖去雜質，然后用少量溶劑迅速洗脫被測物質，從而達到快速分離凈化與濃縮的目的。固相萃取柱也可選擇性吸附干擾雜質，而讓被測物質流出；或同時吸附雜質和被測物質，再使用合適的溶劑選擇性洗脫被測物質。
隨著科技的發展和樣品數量的增多，越來越多的分析實驗室開始使用自動固相萃取儀，特別是多通道固相萃取儀對批量樣品進行處理。在選擇固相萃取柱時，必須考慮柱容量。由于我們面對的樣品基質通常都較為復雜，例如食品、生物樣品等等。在固相萃取中，固相萃取吸附劑對目標化合物吸附的同時，也會吸附同類性質的雜質。因此，在考慮柱容量是應該是目標化合物加上可被吸附的雜質總量不能超過柱容量。否則在載樣的過程中就可能有部分目標化合物不能被吸附，造成回收率偏低。簡單的固相萃取可以通過手工方式完成，即在固相萃取柱上端連接一個注射器，通過對注射器的擠壓將萃取柱內的液體排擠出萃取柱。另外，也可以使用正壓或負壓固相萃取裝置對批量樣品進行固相萃取操作。
如果在樣品加入之前，萃取柱中的填料干了，重復預處理過程。在重新引入有機溶劑之前，固相萃取柱用水沖洗柱中緩沖溶液的鹽。正相類型固相萃取硅膠和極性吸附劑介質，通常用樣品所在的有機溶劑來預處理。離子交換填料將用于非極性有機溶劑中的樣品，其用3-5ml的去離子水或低濃度的離子緩沖溶液來預處理。樣品溶劑的強度相對該吸附劑應該是較弱的，弱溶劑會增強目標化合物在吸附劑上的保留(吸附)。溶劑強度在正﹑反固相萃取中的順序是不同的。如果樣品溶劑的強度太強，目標化合物將得不到保留(吸附)或保留很弱。鑒于固相萃取實質上是一種液相色譜的分離，故原則上講，可作為液相色譜柱填料的材料都可用于固相萃取。但是，由于液相色譜的柱壓可以較高，要求柱效較高，故其填料的粒度要求較嚴格，過去常用10μm粒徑填料，現在柱多用5μ的m填料。
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