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基于SWATH-MS的蛋白質組學在臨床研究中的應用與方案檢測技術服務詳情介紹

在現代臨床研究中，探索疾病的分子機制、尋找早期診斷標志物以及指導個體化治療成為核心課題。dànbáizhì組學作為連接基因表達與表型變化的關鍵研究手段，已被廣泛應用于腫瘤學、免疫學、神經科學等多個領域。近年來，SWATH-MS（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Fragment Ion Mass Spectra）技術作為一種數據獨立采集（DIA）模式，因其高重復性、高通量和廣覆蓋性，在臨床dànbáizhì組學研究中日益受到重視。

一、SWATH-MS技術簡介

SWATH-MS是質譜技術中以“全面掃描"為核心的數據采集策略。在SWATH分析中，質譜儀將全m/z范圍劃分為多個連續的窗口，對所有母離子進行系統性碎裂，進而捕獲幾乎所有可檢測肽段的MS/MS信息。

?? SWATH-MS的優勢：

• 高重復性：能夠在不同批次、不同樣本間獲得穩定的數據；

• 定量范圍廣：涵蓋高低豐度蛋白；

• 信息留存度高：原始數據可在不同研究目標下多次解析。

二、SWATH-MS在臨床研究中的核心應用

在臨床轉化研究中，SWATH-MS技術支持多種研究路徑，能夠對疾病的早期發現、進展監測和療效評估提供蛋白層面的jīngzhǔn依據。

1、疾病標志物篩選

SWATH-MS技術適合處理大規模臨床樣本，通過構建全譜數據集與高質量離子庫，可系統性挖掘差異表達蛋白，并輔助構建基于dànbáizhì表達的分類模型。

2、預后評估與分子分型

對于進展緩慢或臨床異質性大的疾病，SWATH-MS可用于構建分子分型方案。結合多組樣本間的蛋白表達模式，研究者可挖掘不同亞型患者在蛋白水平上的表達特征，從而為臨床提供更加精細化的分類依據，并與臨床結局數據進行關聯分析。

3、藥物響應監測

臨床藥物研發中，個體化治療方案需基于患者對藥物的響應機制建立判斷標準。SWATH-MS可用于對比藥物處理前后的蛋白表達變化，輔助識別作用靶點或調控通路，并分析治療響應與蛋白表達之間的關系，為機制研究和伴隨診斷開發提供數據支持。

4、多組學整合分析

現代臨床研究已逐步從單組學向多組學融合演進。SWATH-MS生成的高通量蛋白數據可與轉錄組、基因組、代謝組等數據進行聯合分析，增強研究對生物通路、調控網絡的理解，并助力構建系統層面的疾病模型。

三、SWATH-MS在臨床研究中的實施方案

SWATH-MS技術的實施效果高度依賴研究方案的設計合理性。以下是幾個關鍵步驟：

1、樣本選擇與預處理

臨床樣本往往來源復雜，包括血清、組織、尿液等。SWATH-MS對樣本制備的標準化要求較高，推薦采用一致的前處理流程（如蛋白抽提、酶解、脫鹽）以控制樣本間的技術變異。此外，樣本采集時間點的統一也是保證生物學一致性的前提。

2、建立高質量離子庫

離子庫決定了SWATH數據中dànbáizhì的識別能力。常規做法是通過DDA模式在代表性樣本中建立初始離子庫，覆蓋盡可能多的肽段信息。也可考慮整合已有公共數據庫，或利用多樣本混合策略增強離子庫的普適性。

3、數據采集參數優化

采集窗口的數量與寬度需根據儀器性能和樣本復雜度權衡設定。較窄的窗口可提高選擇性，但增加循環時間；反之則影響低豐度肽段的識別率。因此應通過預實驗進行優化，確保在覆蓋范圍和定量精度間取得平衡。

4、數據解析與生物信息學分析

SWATH-MS的數據處理依賴成熟的軟件工具（如OpenSWATH、DIA-NN、Spectronaut等），可進行肽段識別、峰面積提取、歸一化與差異分析。后續可結合通路富集分析、網絡構建及臨床指標相關性分析，挖掘具有臨床意義的蛋白特征。

SWATH-MS技術以其全面、穩定、可擴展的特點，正在成為臨床dànbáizhì組學研究的關鍵平臺。它為疾病標志物篩選、分子分型、藥物響應分析等提供了可靠的定量數據支持，也為多組學整合研究提供了堅實的蛋白基礎。百泰派克生物科技長期關注SWATH-MS及其他dànbáizhì組學技術在臨床研究中的應用，致力于為科研人員提供高質量的SWATH定量蛋白組學服務，加速從分子發現到臨床轉化的全過程。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

基于SWATH-MS的蛋白質組學在臨床研究中的應用與方案檢測技術服務詳情介紹