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批量 RNA 測序(Bulk RNA Sequencing)是一種利用高通量測序技術分析樣本中所有 RNA 分子表達水平的技術。相比傳統的基因表達分析方法(如微陣列技術),批量 RNA 測序具有更高的靈敏度、分辨率和動態范圍,它可以全面捕獲樣本中的轉錄組信息,包括編碼 RNA 和非編碼 RNA 的表達量、基因融合、可變剪切以及突變分析。這一技術已成為研究基因功能和細胞生物學的重要工具。批量 RNA 測序的核心是通過測量樣本中所有 RNA 的表達水平,揭示基因在不同條件下的轉錄調控模式。它通常用于分析細胞群體、組織或生物體中 RNA 的整體表達趨勢而不關注單個細胞的異質性。該技術在研究疾病與健康狀態之間的差異、基因調控網絡以及信號通路分析中發揮作用。例如,在癌癥研究中,批量 RNA 測序可以揭示癌組織與正常組織之間的差異表達基因,幫助識別潛在的致癌基因和治療靶點;在藥物研發中,分析藥物處理前后基因表達的變化可以評估藥物的分子機制和療效。
批量 RNA 測序的實驗流程包括 RNA 提取、建庫與測序和數據分析三個主要階段。首先,從樣本中提取總 RNA 或特定 RNA(如 mRNA 或小 RNA)并去除基因組 DNA 和其他雜質。對于復雜樣本,可以選擇富集特定 RNA 亞型(如通過 Poly(A) 選擇富集 mRNA)或去除不感興趣的 RNA(如核糖體 RNA)。接下來,通過逆轉錄將 RNA 轉化為 cDNA并構建高通量測序所需的文庫。文庫構建的關鍵步驟包括片段化、接頭連接和擴增,以確保獲得高質量的測序數據。zuì后,利用下一代測序(NGS)技術生成大規模數據,這些數據可用于后續的生物信息學分析。
數據分析是批量 RNA 測序的核心環節,其目標是從海量數據中提取有意義的生物學信息。分析流程通常包括原始數據質量控制、基因組比對、定量分析和差異表達分析等步驟。原始數據質量控制旨在去除低質量序列和測序接頭以保證后續分析的可靠性;基因組比對則是將測序片段與參考基因組或轉錄組進行匹配以確定其來源基因。定量分析通過計算每個基因的片段數(如 FPKM、TPM 或 Counts)來反映其表達水平。zuì后,通過差異表達分析(如 DESeq2、edgeR 等軟件)比較不同條件下的基因表達差異,并結合功能富集分析(如 GO 和 KEGG 分析)探索潛在的生物學機制。
批量 RNA 測序的優勢在于能夠以全面、jīngquè和高通量的方式獲取樣本的轉錄組信息,但是它也有一定的局限性。由于該方法基于群體樣本的平均表達水平,無法解析細胞異質性和稀有細胞群體的特異性基因表達。此外,樣本質量(如 RNA 降解和污染)以及數據分析的復雜性也可能影響結果的可靠性。因此,在設計實驗時需要嚴格控制變量,優化實驗流程,并結合適當的生物信息學方法對數據進行深入挖掘。
百泰派克生物科技憑借豐富的 RNA 測序經驗和強大的生物信息學分析能力,能夠為客戶提供一站式測序服務。從樣本準備到數據解析,我們為客戶量身定制zuì優實驗方案,確保結果的高質量和高可靠性。如果您需要探索基因表達調控或發現新的轉錄組特征,百泰派克將是您zhídexìnlài的合作伙伴,助力您的研究取得突破性進展。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白zhìzǔxué分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術先進,填補技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
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