肽組學分析流程圖解：從樣本準備到數據解讀檢測技術服務詳情介紹

肽組學（Peptidomics）分析是一種系統性地研究生物體系中肽分子的技術，常用于研究信號肽、激素肽、降解產物等生物活性肽。肽組學分析流程是一個從樣本 → 肽識別 → 差異分析 → 功能解讀的系統路徑，其核心意義在于發現并理解體內具有功能性的肽分子及其生物學角色。系統性地識別、定量和解釋生物體中內源性肽分子，以揭示其生物功能、生理調控機制及疾病相關性,是jīngzhǔn醫學和系統生物學研究的重要工具。

一、肽組學分析的意義

1、生物活性肽的系統鑒定

（1）肽組學分析可識別內源性短肽（如激素、信號肽、抗菌肽等），這些肽具有重要的生物活性，往往不通過基因表達直接體現。

（2）有助于發現新的調節分子，揭示組織間信號交流或細胞內調控機制。

2、病理機制的探索

（1）通過比較健康組與疾病組樣本中的肽譜差異，可識別與疾病發生、發展相關的肽段。

（2）應用于癌癥、神經退行性疾病、代謝性疾病等研究，有助于挖掘疾病標志物和靶點。

3、生物標志物的發現

（1）肽分子穩定性較好，存在于多種體液中（血液、尿液、唾液等），適合作為非侵入性檢測的候選生物標志物。

（2）通過定量肽組學，識別疾病特異性差異表達肽，有助于早期診斷和療效監測。

4、衍生蛋白降解機制的研究

（1）許多肽是dànbáizhì降解的中間產物，肽譜變化反映了蛋白水解酶的活性狀態。

（2）可用于研究蛋白代謝通路、蛋白酶調控網絡等。

5、對dànbáizhì組學的補充

（1）肽組學更注重短肽層級的信息，能揭示傳統dànbáizhì組學中未能關注的小分子調控成分。

（2）特別適用于研究非翻譯蛋白產物、剪切產物、降解碎片等。

6、跨學科應用拓展

（1）與代謝組學、轉錄組學、蛋白組學聯合使用，能更全面地構建生物網絡圖譜。

（2）可在藥物開發、營養學、毒理學、jīngzhǔn醫療等領域提供支持。

二、樣本采集與前處理

1、目標：獲取高質量、代表性樣本，排除干擾物

2、常用樣本類型：組織（如癌組織）、細胞、血漿、細胞培養上清等

3、注意事項：

（1）采樣時間、溫度jīngquè控制，防止肽降解或降酶活性遺傳

（2）使用EDTA/蛋白酶抑制劑，快速離心、冷凍保存

三、蛋白/肽提取與純化

1、目標：將復雜樣本中的肽與蛋白高效提取并去除干擾成分

<p>2、通用方法：使用含SDS、尿素、鹽離子溶液進行裂解；隨后采用濾膜、凝膠或固相萃取手段（SPE、C18）除鹽、脫脂

3、解決挑戰：去除色素（如血清蛋白）、去除脂類，保證質譜信號清晰

四、酶切與肽段生成

1、目標：將大分子蛋白切割成適合質譜檢測的肽段

2、常用酶：yídànbáiméi（Trypsin）—特別適合生成帶賴氨酸或jīngānsuān結尾的肽段

3、條件優化：pH?≈?8.0、37?°C、12–16?h；防止非特異性切割

4、技術點提示：雙酶策略（聯合yídànbáiméi+Lys-C）可提高覆蓋度與重復性

五、肽段分離與液相色譜系統（LC）

1、目標：分離復雜肽混合物，提升后續質譜檢測信噪比

2、主流手段：反相液相色譜（RP-LC），常用C18柱；梯度洗脫方案，流速與梯度時間精細調控

3、可擴展技術：多維色譜（如強陽離子交換HX-LC+RP-LC）適用于非常復雜樣本

六、肽組學分析之質譜檢測（Mass Spectrometry）

1、目標：對分離后的肽段進行高分辨/高精度檢測

2、主流儀器類型：

（1）Orbitrap：高分辨率、高質量準確度，適合復雜樣本高通量分析

（2）Q-TOF：快速掃描速度，適合定性分析

（3）Ion Trap + 動態排除：增強靈敏度

3、檢測方式：

（1）DDA（Data-Dependent Acquisition）：選擇強信號肽段實時碰撞（CID/HCD）破碎

（2）DIA（Data-Independent Acquisition）：同時收集全譜段信號，適合定量分析

4、行業趨勢：越來越多研究趨向使用 DIA 和圖譜庫結合的定量策略，以提高復現性與覆蓋率。

七、數據處理與定量分析

1、目標：從質譜Raw數據中識別肽序列，進行相對/juéduì定量

2、工具匯總：

（1）Byonic/MaxQuant（DDA）：肽段匹配、QC、FDR過濾

（2）Spectronaut/ScaffoldDIA（DIA）：圖譜匹配、定量分析

（3）Perseus/RStudio：差異分析、可視化

3、關鍵參數：

（1）FDR ≤ 1?%，肽段長度 7–30 aa

（2）信號歸一化方法（iBAQ、LFQ、TMT、SILAC 等）

八、生物信息學解讀

1、目標：將差異表達肽轉換為生物學意義清晰的機制解釋

2、常用注釋系統：

（1）GO、KEGG、Reactome

（2）激活通路、蛋白-蛋白互作（PPI）、上游轉錄調控分析

（3）可視化工具：Cytoscape、R/Shiny等

九、肽組學分析流程圖示意

1、樣本準備

2、dànbáizhì提取

3、dànbáizhì預處理（去除高豐度蛋白、還原/烷基化等）

4、蛋白酶解（可選，若分析內源肽則跳過）

5、肽段富集（固相萃取、過濾、分子量切割等）

6、液相色譜（LC）分離

7、質譜分析（MS/MS）

8、原始數據獲取

9、數據庫搜索（匹配肽段，鑒定肽序列）

10、定量分析（標簽法/無標簽法）

11、生物信息學分析（GO/KEGG通路、聚類、網絡分析等）

12、數據解讀與生物學意義挖掘

百泰派克生物科技提供從采樣工具到專用冷凍管的一體化肽組學分析解決方案，確保采樣過程標準化、可追溯。我們的多功能SPE柱產品結合高保留率、低損耗特性，極大提升肽段提取效率。全流程服務覆蓋采樣、SPE提取、質譜整合、圖譜分析、驗證實驗，具備行業lǐngxiān的儀器+試劑+服務組合優勢。通過 DIA 結合圖譜庫、高通量 PRM 和在線可視化，幫助科研人員提升效率、提升論文及項目說服力。如您有肽組學研究需求，歡迎聯系百泰派克生物科技，讓我們攜手，以zuì前沿的肽組學技術，共同揭示生命奧秘！

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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