MS/MS多肽測序的優(yōu)勢與局限檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

多肽測序（Peptide Sequencing）技術(shù)，是指通過實(shí)驗(yàn)手段確定多肽分子中氨基酸的排列順序（即一級結(jié)構(gòu)）以及可能存在的翻譯后修飾（PTMs）的關(guān)鍵技術(shù)。通過該項(xiàng)技術(shù)，科研人員可確定多肽中氨基酸的線性順序（一級結(jié)構(gòu)）；定位翻譯后修飾（PTMs），揭示蛋白功能調(diào)控機(jī)制；而 MS/MS（串聯(lián)質(zhì)譜）通過選擇性母離子碎片化，MS/MS不僅提供氨基酸序列信息，還能定位翻譯后修飾（PTMs）及區(qū)分復(fù)雜樣品中的同分異構(gòu)體，已成為這一領(lǐng)域的關(guān)鍵工具，為實(shí)現(xiàn)研究目的，MS/MS多肽測序的優(yōu)勢與局限成為了研究重點(diǎn)。

一、MS/MS多肽測序技術(shù)原理概述

MS/MS多肽測序的基本原理是利用高分辨質(zhì)譜技術(shù)，將dànbáizhì酶解后的多肽段離子化后進(jìn)行質(zhì)量檢測（MS1），隨后選定母離子（前體肽段）進(jìn)行選擇性碎片化（MS2），記錄碎片離子的質(zhì)量信息，推導(dǎo)氨基酸序列及翻譯后修飾信息。

核心步驟：

（1） 蛋白酶解：采用yídànbáiméi、Lys-C等特異性酶將dànbáizhì分解成多肽。

（2） 離子化與檢測：通過ESI（電噴霧電離）或MALDI（基質(zhì)輔助）實(shí)現(xiàn)離子化，MS1檢測肽段質(zhì)量。

（3） 選擇性碎片化（MS2）：母離子在碰撞室中通過CID（碰撞誘導(dǎo)解離）、HCD（高能碰撞解離）或ETD/ECD（電子轉(zhuǎn)移/俘獲解離）生成b、y離子系列。

（4） 數(shù)據(jù)解析：比對實(shí)驗(yàn)碎片譜與理論肽段（數(shù)據(jù)庫搜索），或采用de novo算法直接推導(dǎo)序列，定位翻譯后修飾（PTMs）信息。

二、MS/MS多肽測序的優(yōu)勢詳解

1、高靈敏度與分辨率

MS/MS結(jié)合高分辨質(zhì)譜（Orbitrap、FTICR），可實(shí)現(xiàn)亞ppm級質(zhì)量精度，靈敏度可探測低豐度、多修飾、多異構(gòu)的肽段，顯著優(yōu)于傳統(tǒng)PMF（肽指紋圖譜）。

2、 提供氨基酸序列與修飾定位信息

通過b、y離子系列碎片譜，直接解析肽段氨基酸排列順序。jīngzhǔn定位PTMs（如磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化），揭示功能調(diào)控機(jī)制。

3、高通量解析復(fù)雜樣品

結(jié)合LC（液相色譜），可解析血漿、組織、細(xì)胞裂解液等復(fù)雜樣品中上千種多肽，適用于蛋白zhìzǔxué和臨床標(biāo)志物研究。

4、多解離模式與AI算法加持

ETD/ECD解離保留修飾信息，適用于磷酸化、糖基化等易失修飾。HCD/CID解離適用于高能碎裂和常規(guī)多肽分析。結(jié)合AI算法（如Prosit、deepNovo）及深度學(xué)習(xí)，顯著提高碎片譜解析效率和準(zhǔn)確度。

5、支持未知蛋白與新抗原發(fā)現(xiàn)

通過de novo測序，無需數(shù)據(jù)庫即可推導(dǎo)未知蛋白或非模式物種肽段序列，適用于新抗原發(fā)現(xiàn)、疫苗設(shè)計(jì)、疾病標(biāo)志物篩選。

三、MS/MS多肽測序的局限性剖析

1、對儀器和操作要求高

需要高分辨、高靈敏度質(zhì)譜平臺（如Orbitrap Fusion Lumos、Q-Exactive HF-X），設(shè)備投資大、操作復(fù)雜。對樣品離子化效率要求高，需嚴(yán)格控制樣品純度與處理流程。

2、數(shù)據(jù)量大、解析復(fù)雜

MS/MS碎片譜數(shù)據(jù)龐大，需zhuānyè數(shù)據(jù)庫搜索（Mascot、MaxQuant、Byonic）和算法比對。大規(guī)模數(shù)據(jù)處理需高性能計(jì)算資源和算法優(yōu)化，耗時(shí)較長。

3、樣品準(zhǔn)備與酶解挑戰(zhàn)

蛋白酶解效率低、肽段提取困難、鹽污染均會(huì)影響測序質(zhì)量。疏水肽段（如膜蛋白）難提取、電離效率低，需優(yōu)化樣品處理。

4、特殊修飾識別難度大

某些修飾（如O-糖基化）易在CID/HCD中脫落，導(dǎo)致修飾信息丟失。需采用ETD/ECD解離、化學(xué)標(biāo)記等輔助策略。

5、同分異構(gòu)體分辨能力有限

含相同氨基酸組成但不同順序的同分異構(gòu)體肽段，碎片譜相似，難以區(qū)分。需結(jié)合保留時(shí)間、同位素分布和AI輔助判別。

四、MS/MS多肽測序的科研應(yīng)用與前沿趨勢

1、應(yīng)用領(lǐng)域

（1）蛋白zhìzǔxué：高通量解析蛋白表達(dá)、相互作用網(wǎng)絡(luò)，揭示生命過程機(jī)制。

（2）翻譯后修飾研究：定位磷酸化、乙酰化、糖基化等修飾位點(diǎn)，解析功能調(diào)控機(jī)制。

（3）新抗原發(fā)現(xiàn)：應(yīng)用于腫瘤miǎnyìzhìliáo、疫苗設(shè)計(jì)、疾病標(biāo)志物挖掘。

（4）臨床診斷與jīngzhǔn醫(yī)學(xué)：篩選特異性肽段，用于早篩、診斷及療效監(jiān)測。

（5）生物制藥質(zhì)量控制：驗(yàn)證蛋白藥純度、一致性、結(jié)構(gòu)完整性。

2、發(fā)展趨勢

（1）多維質(zhì)譜與單細(xì)胞測序：推動(dòng)從單肽到空間、單細(xì)胞層次解析。

（2）AI與深度學(xué)習(xí)輔助：提升復(fù)雜樣本肽段解析與修飾定位精度。

（3）多技術(shù)融合平臺：結(jié)合質(zhì)譜成像（MSI）、原位質(zhì)譜（DESI-MS），構(gòu)建多維蛋白組學(xué)圖譜。

MS/MS多肽測序以其高分辨率、序列解析能力與修飾識別優(yōu)勢，已成為現(xiàn)代蛋白zhìzǔxué與生命科學(xué)研究中bùkětìdài的核心技術(shù)。作為蛋白zhìzǔxué與多肽測序領(lǐng)域的lǐngxiān企業(yè)，百泰派克生物科技依托*質(zhì)譜平臺（Orbitrap Fusion Lumos、Q-Exactive HF-X、MALDI-TOF/TOF、ETD/ECD模塊）及自主研發(fā)的樣品制備與數(shù)據(jù)解析流程，提供從樣品到數(shù)據(jù)全流程多肽測序解決方案；高靈敏度檢測低豐度、多修飾肽段，提升數(shù)據(jù)質(zhì)量與解析深度；多引擎與AI算法加持，提高復(fù)雜樣本的準(zhǔn)確率和效率；zhuānyè團(tuán)隊(duì)與定制化支持，為科研與企業(yè)客戶量身定制測序方案，解決從樣品制備到數(shù)據(jù)解讀全鏈路需求，繼續(xù)致力于為全球科研人員與企業(yè)客戶提供高質(zhì)量、定制化的多肽測序解決方案，共同推動(dòng)生命科學(xué)與生物醫(yī)藥創(chuàng)新發(fā)展。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白zhìzǔxué分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

MS/MS多肽測序的優(yōu)勢與局限檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹