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ABPP如何補足表達組學的功能盲區?

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品       牌百泰派克

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更新時間:2025-07-09 16:55:30瀏覽次數:58次

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ABPP如何補足表達組學的功能盲區?檢測技術服務: 在多組學數據日益豐富的jīntiān,表達組學(Transcriptomics) 依舊是揭示基因調控機制的主力手段之一。通過RNA-Seq等技術,研究者可以全面掌握基因在不同條件下的轉錄表達情況。然而,這種“表達即功能"的邏輯推演,正面臨一個難以回避的盲區:轉錄水平的變化并不等于蛋白的活性狀態發生了變化。而這正是活性位點導向dànbáizhì譜技

ABPP如何補足表達組學的功能盲區?檢測技術服務詳情介紹

在多組學數據日益豐富的jīntiān,表達組學(Transcriptomics) 依舊是揭示基因調控機制的主力手段之一。通過RNA-Seq等技術,研究者可以全面掌握基因在不同條件下的轉錄表達情況。然而,這種“表達即功能"的邏輯推演,正面臨一個難以回避的盲區:轉錄水平的變化并不等于蛋白的活性狀態發生了變化。而這正是活性位點導向dànbáizhì譜技術(Activity-Based Protein Profiling, ABPP) 所擅長的領域。ABPP(Activity-Based Protein Profiling,基于活性的小分子探針蛋白zhìzǔxué)是一種研究dànbáizhì功能狀態的強大化學蛋白zhìzǔxué技術。它能夠有效補足表達組學(如轉錄組、傳統dànbáizhì組)存在的“功能盲區"。ABPP如何補足表達組學的功能盲區?剖析ABPP技術如何補足表達組學的不足,并介紹其在藥物發現、疾病標志物篩選等方面的應用潛力是當今科研人員面臨的重要課題。


一、表達組學的“功能盲區"是什么?

1、表達組學(如轉錄組和傳統dànbáizhì組)通常測量的是:

(1)mRNA水平(轉錄組):反映基因的轉錄活性,但無法說明蛋白是否翻譯、是否活躍

(2)蛋白水平(dànbáizhì組):反映蛋白的表達豐度,但不能判斷其酶活性或功能狀態


2、因此,它們存在以下盲區:

(1)無法區分活性與非活性蛋白(如失活酶、變構調節等)

(2)忽略dànbáizhì翻譯后修飾(PTMs)帶來的功能變化

(3)無法反映蛋白功能狀態的動態調控(如底物結合、酶-抑制劑相互作用)

(4)對于低豐度但高功能活性的蛋白不敏感

這些問題共同構成了一個關鍵盲點——我們知道某個基因被表達了,卻無法確認它是否“在工作"。要想真正理解細胞在生理或病理狀態下的功能變化,需要超越表達,走向“活性"。


二、ABPP的基本原理

ABPP是一種基于小分子探針的質譜技術,專門用于篩選和標注活性狀態下的dànbáizhì亞群。

1、其基本原理是:

(1)利用具有高選擇性的反應性探針,共價修飾活性中心

(2)通過標記富集,將目標蛋白從復雜背景中“釣"出來

(3)借助高分辨率LC-MS/MS對其進行識別和定量

與蛋白zhìzǔxué相比,ABPPzuì大的優勢在于其選擇性標記活躍dànbáizhì,而非所有表達的蛋白。這使得它可以直接捕捉功能狀態的變化,而不僅僅是數量上的浮動。


三、ABPP探針通常包含

(1)反應基團:共價結合酶活性位點

(2)報告基團:用于富集、熒光成像或質譜分析

(3)連接臂:將反應基團與報告基團連接

探針僅與活性形式的蛋白結合

(1)因此能夠選擇性捕捉功能性蛋白

(2)區分不同功能狀態的同一蛋白

(3)監測動態變化(如藥物作用、病理狀態)


四、ABPP如何補足表達組學?

1、 彌合表達與功能的鴻溝

通過在轉錄組學之后增加ABPP層面的驗證,研究者可以快速確認哪些基因的表達變化真正轉化為蛋白功能的改變,大幅提高候選靶點的生物學可信度。


2、 揭示隱藏的調控通路

ABPP特別適合分析代謝酶、蛋白酶、磷酸酶等酶類蛋白的活性狀態,在細胞信號傳導、免疫應答等領域jíjù優勢,能夠補足表達組學在通路分析上的空白。


3. 增強多組學整合價值

在整合轉錄組、蛋白組和代謝組時,ABPP作為功能層面的錨點,可增強組學之間的生物學聯動解釋力,推動真正意義上的系統生物學分析。


五、實際應用場景

1、腫瘤研究:發現活躍的致癌酶、代謝通路

2、藥物靶點發現:識別真實靶點 vs 離靶效應

3、免疫學:研究活性酶在炎癥反應中的作用

4、微生物生態:捕捉功能相關蛋白而非僅依賴序列注釋

5、疾病早期診斷標志物開發:通過活性變化尋找生物標志物


ABPP實驗的成功并不只取決于儀器靈敏度,更高度依賴于探針設計的合理性與樣品處理流程的嚴謹性。百泰派克生物科技結合多年質譜平臺經驗,打造了從探針篩選、樣本富集、活性標記、定量分析到生物信息學解讀的全流程ABPP服務。我們具備:高通量Orbitrap質譜平臺,確保活性蛋白的jīngzhǔn識別與定量;完善的生物信息分析流程,支持與轉錄組、蛋白組等數據,配合我們自研的樣品前處理流程與QC控制體系,即使是復雜組織或臨床樣本也能保證數據一致性與可重復性。我們將幫助科研人員快速定位關鍵靶標,并提出具有機制假說價值的研究方向。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。


※服務優勢:

1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白zhìzǔxué分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。


※服務優勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。



三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。


※服務優勢:

1.技術*,*技術空白

采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大,成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

ABPP如何補足表達組學的功能盲區?




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;

2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;

3.業務范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;

4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;

5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!



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