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HLA肽組學如何助力癌癥抗原識別?

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品       牌百泰派克

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更新時間:2025-07-04 11:35:01瀏覽次數(shù):88次

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HLA肽組學如何助力癌癥抗原識別?檢測技術(shù)服務(wù): 腫瘤miǎnyìzhìliáo(Cancer Immunotherapy)核心問題:T細胞如何識別腫瘤? T細胞并不直接識別癌細胞本身,而是通過主要組織相容性復(fù)合體(MHC,亦稱HLA)呈遞的肽段,間接判斷細胞是否“異常"。因此,識別并解析HLA呈遞肽段,尤其是那些源自癌基因突變、異常表達或病毒整合的“癌癥抗原肽",就成為構(gòu)建腫瘤疫苗、TCR-T細

HLA肽組學如何助力癌癥抗原識別?檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

腫瘤miǎnyìzhìliáo(Cancer Immunotherapy)核心問題:T細胞如何識別腫瘤?


T細胞并不直接識別癌細胞本身,而是通過主要組織相容性復(fù)合體(MHC,亦稱HLA)呈遞的肽段,間接判斷細胞是否“異常"。因此,識別并解析HLA呈遞肽段,尤其是那些源自癌基因突變、異常表達或病毒整合的“癌癥抗原肽",就成為構(gòu)建腫瘤疫苗、TCR-T細胞療法等免疫策略的前提。而實現(xiàn)這一目標的關(guān)鍵技術(shù)之一,正是HLA肽組學(Immunopeptidomics)。


一、什么是HLA肽組學?

HLA肽組學,是指以質(zhì)譜為核心手段,系統(tǒng)性解析HLA分子在體內(nèi)呈遞的內(nèi)源性肽段(通常為8-12個氨基酸)的研究技術(shù)。這些肽段代表著細胞代謝狀態(tài)、突變情況和抗原負荷,是T細胞識別的“分子shēnfènzhèng"。HLA肽組學解決的問題不是“有哪些蛋白表達",而是——“這些蛋白zuì終是如何被切割、加工,并呈遞給T細胞看的?"


二、HLA肽組學如何“直觀還原"真實抗原呈遞?

1、免疫親和純化 + 質(zhì)譜解析

利用特異性抗體從細胞表面富集HLA-I/II復(fù)合物,釋放其中的結(jié)合肽段,并通過高分辨率質(zhì)譜(如Orbitrap Exploris 480)直接鑒定其序列,是HLA肽組學的基本流程。相比計算預(yù)測,這種方法具有:

(1)原位識別真實存在的抗原肽

(2)捕獲突變肽段(Neoantigens)

(3)識別來自病毒、轉(zhuǎn)座子等非典型源的肽段

百泰派克生物科技已建立穩(wěn)定高通量的HLA肽純化與檢測流程,兼容多種樣本類型(細胞系、腫瘤組織、PBMC等),并具備低起始量(百萬級細胞)處理能力。


2、聚焦“新抗原"(Neoantigen)

新抗原是來源于腫瘤tèyǒu突變或融合基因的新生肽段,具備“僅腫瘤表達、不存在于正常組織"的優(yōu)勢,是T細胞免疫識別的理想靶點。HLA肽組學通過將質(zhì)譜數(shù)據(jù)與患者WES/RNA-seq等基因組信息整合,可實現(xiàn):

(1)個體化新抗原挖掘

(2) 多個突變位點肽段并行驗證

(3)“優(yōu)先呈遞"肽段的免疫原性評估

這為個性化癌癥疫苗設(shè)計與TCR-T細胞工程提供了關(guān)鍵支撐。


3、跨越預(yù)測誤差

當前多數(shù)抗原篩選仍依賴于HLA結(jié)合預(yù)測算法(如NetMHCpan),但僅有10–20%的預(yù)測肽段可被實際呈遞。HLA肽組學提供“實驗實錘",有效避免開發(fā)“預(yù)測靶點"卻無法激活免疫反應(yīng)的失敗案例。


4、發(fā)掘修飾肽、非標準抗原

部分癌癥相關(guān)抗原并非源自經(jīng)典蛋白翻譯,而是:

(1)非編碼區(qū)翻譯產(chǎn)物(uORFs、lncRNA等)

(2)翻譯后修飾(磷酸化、甲基化)調(diào)控的肽段

(3)裂解產(chǎn)生的雜合肽(spliced peptides)


三、應(yīng)用價值:HLA肽組學賦能癌癥免疫jīngzhǔn化



HLA肽組學如何助力癌癥抗原識別?


百泰派克生物科技:HLA肽組學一站式服務(wù)

我們提供完整的HLA肽組學科研服務(wù)鏈條,覆蓋從實驗設(shè)計到數(shù)據(jù)解讀的全流程:

(1)高親和HLA復(fù)合物富集流程,提高弱表達肽段檢測率

(2)質(zhì)譜平臺:Orbitrap Exploris + nanoLC系統(tǒng),支持大規(guī)模樣本并行分析

(3)生信分析:HLA分型+突變肽匹配+免疫原性打分

(4)多組學整合:融合轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、單細胞數(shù)據(jù),jīngzhǔn定位關(guān)鍵抗原源頭

(5)合作定制開發(fā):支持TCR-T項目靶點共建、疫苗設(shè)計驗證等產(chǎn)業(yè)化落地

在腫瘤miǎnyìzhìliáo日趨個性化、jīngzhǔn化的當下,僅靠預(yù)測已難滿足臨床研發(fā)需求。HLA肽組學正以其實驗驗證性、高靈敏度、廣覆蓋度的優(yōu)勢,將我們帶入腫瘤真實抗原呈遞的分子視界。百泰派克生物科技致力于推動HLA肽組學的科研與應(yīng)用落地,為新抗原發(fā)現(xiàn)、免疫靶點開發(fā)和T細胞工程等方向提供zhuānyè支持,助力科研團隊站在癌癥免疫的技術(shù)前沿。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務(wù),助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統(tǒng)準確。



三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)*,*技術(shù)空白

采用金屬標記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

HLA肽組學如何助力癌癥抗原識別?




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



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