當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術服務>>蛋白分析>> 蛋白質結構分析的五大常用方法及應用場景
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dànbáizhì的功能與其三維結構密切相關,結構信息不僅有助于解釋其生物學行為,還廣泛應用于藥物設計、抗體工程、代謝通路解析等多個研究方向。當前,研究者可選擇多種技術手段對dànbáizhì結構進行分析,每種方法側重點不同,適用于不同類型的dànbáizhì與研究目標。
一、X射線晶體衍射(X-ray Crystallography)
??方法簡介
X射線晶體衍射是高分辨率的結構解析方法,通過測量dànbáizhì晶體對X射線的衍射圖樣,構建其電子密度圖并還原原子排布。該技術可實現0.8?以下的原子級精度。
??應用場景
高分辨率結構建模:適用于構建單體蛋白或復合物的jīngquè三維模型。
靶向藥物設計:支持結構基礎上的小分子篩選與優化。
功能機制研究:有助于揭示酶催化位點、活性中心構型等關鍵結構細節。
??注意事項
對晶體質量要求jígāo,部分dànbáizhì(如膜蛋白、大型復合物)難以結晶。
二、冷凍電鏡(Cryo-Electron Microscopy, Cryo-EM)
??方法簡介
冷凍電鏡以電子束代替光源,直接對快速冷凍后的dànbáizhì顆粒進行成像與三維重構。無需結晶、樣品需求量少,是結構生物學中快速崛起的重要手段。
??應用場景
大型復合物結構解析:適合核糖體、病毒顆粒等高分子量體系。
膜蛋白研究:解決晶體衍射難以應對的膜類蛋白結構問題。
多構象狀態分析:可觀察dànbáizhì在不同功能狀態下的形態變化。
??注意事項
對樣品均一性、數據采集與圖像處理能力要求高,適合有一定基礎的研究團隊。
三、核磁共振波譜(Nuclear Magnetic Resonance, NMR)
??方法簡介
NMR利用核自旋在磁場中的共振行為分析原子之間的距離與連接方式,在溶液狀態下重建dànbáizhì的三維結構,尤其適合研究dànbáizhì的動態變化。
??應用場景
小分子蛋白結構解析:適合分子量在30kDa以下的dànbáizhì。
dànbáizhì動態行為研究:可捕捉構象交換、柔性結構域及內在無序區域。
dànbáizhì-配體相互作用監測:揭示結合位點及結合后的構象響應。
??注意事項
解析效率隨分子量上升迅速下降,對設備和樣品制備要求較高。
四、交聯-質譜(Cross-Linking Mass Spectrometry, XL-MS)
??方法簡介
XL-MS通過化學交聯劑固定dànbáizhì中相鄰氨基酸殘基,然后用質譜技術檢測交聯肽段,推測其空間近距離關系,從而對整體構象做出結構約束。
??應用場景
粗粒度構象模型構建:為三維建模提供距離限制信息。
dànbáizhì互作分析:識別dànbáizhì間或蛋白內部的關鍵接觸區域。
驗證其他結構數據:常用于補充Cryo-EM、XRD的結構模型。
??注意事項
分辨率較低,通常用于輔助研究或高通量篩查,不可獨立作為主結構模型依據。
五、氫氘交換質譜(Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry, HDX-MS)
??方法簡介
HDX-MS基于氨基酸骨架氫原子與氘水中氘的交換反應,監測dànbáizhì不同區域的溶劑暴露程度和構象穩定性,反映其動態結構信息。
??應用場景
構象變化追蹤:適合研究dànbáizhì活化、折疊、穩定性變化等現象。
抗原-抗體結合位點映射:廣泛用于抗體工程和生物藥開發。
dànbáizhì工程優化:識別柔性區域,輔助設計更穩定構型。
??注意事項
實驗敏感度高,數據處理依賴質譜解析能力和軟件算法支持。
六、方法選擇建議
不同結構分析技術在分辨率、動態信息、樣品適應性與通量方面各有側重,通常應根據具體科研問題組合使用:
隨著生物醫藥、合成生物學等領域對dànbáizhì結構信息需求的提升,科研人員正面臨樣品復雜、目標多樣、周期緊張等多重挑戰。選擇適當的結構解析方法,并進行高質量的樣品處理與數據解讀,是確保科研成功的關鍵。百泰派克生物科技立足蛋白組學與質譜技術,結合結構生物學的應用需求,提供dànbáizhì結構鑒定服務。我們致力于與科研人員共同推進dànbáizhì結構功能研究,助力原始創新與技術轉化。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
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