當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術服務>>單細胞分析>> 單細胞蛋白質組學發展現狀與未來趨勢
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在生命科學研究日益精細化的jīntiān,單細胞水平的分子解析能力成為突破細胞異質性研究瓶頸的關鍵。單細胞RNA測序(scRNA-seq)已廣泛應用于發育生物學、免疫學、腫瘤學等領域,揭示了豐富的細胞間表達差異。然而,mRNA并不能直接反映細胞的功能狀態,dànbáizhì才是真正的功能執行者。因此,單細胞dànbáizhì組學(Single-Cell Proteomics, SCP)應運而生,并迅速發展為探索細胞功能和狀態的關鍵技術之一。
一、單細胞dànbáizhì組學的發展現狀
1、技術突破推動平臺建設
單細胞dànbáizhì組學的本質挑戰在于如何在極其微量的樣本中實現高靈敏度、高通量的蛋白鑒定與定量。技術上的關鍵突破為SCP的發展奠定了堅實基礎:
超微量樣品處理技術日趨成熟:從早期手動加樣到如今的納升級自動化液體處理系統(如nanoPOTS、ProteoCHIP等),樣本損耗顯著降低,樣本重復性和處理效率大幅提升。
質譜靈敏度顯著提高:新一代高分辨質譜平臺(如Orbitrap Eclipse、Bruker timsTOF SCP)結合并行累積、多維分離和增強離子傳輸等技術,使得單細胞層面的dànbáizhì組檢測成為可能。
標簽定量與并行分析技術優化:利用TMT等異位標記技術,可實現多個單細胞樣本的并行檢測,在提升通量的同時改善定量精度。
數據處理與算法進步:面向高缺失、低覆蓋率數據的分析算法不斷優化,如Bayesian建模、深度學習嵌入方法、稀疏矩陣補全等,為單細胞蛋白數據賦予更高的解釋力。
2、應用場景逐漸豐富
目前,單細胞dànbáizhì組學已在多個研究方向中嶄露頭角:
細胞異質性分析:識別亞群、表型轉換路徑、干性狀態等;
腫瘤研究:解析腫瘤微環境、耐藥機制、免疫逃逸通路;
干細胞與再生醫學:探究干細胞分化過程中的蛋白表達軌跡;
神經科學:研究神經元功能狀態、信號傳導及代謝變化;
免疫研究:解析免疫細胞激活狀態與抗原識別通路。
盡管應用正在不斷擴展,但大多數研究仍處于實驗驗證或方法開發階段,距離廣泛的臨床應用仍需時間。
二、單細胞dànbáizhì組學的未來趨勢
1、向高通量、高覆蓋率方向演進
下一階段的發展將聚焦于提升每個單細胞的檢測深度與批量處理能力。例如,通過改進離子注入效率、增強數據獨立采集(DIA)策略、整合離子遷移譜等手段,有望在不犧牲靈敏度的前提下提升通量。此外,納米流體系統與芯片化分析平臺的結合將進一步推動SCP向自動化、高通量發展,適應更大規模研究需求。
2、向蛋白修飾與功能狀態解析擴展
未來的SCP將不僅局限于總蛋白定量,而是擴展到蛋白翻譯后修飾(PTMs)、蛋白-蛋白互作、亞細胞定位等維度,提升生物學解釋的深度與廣度。例如,單細胞磷酸化組學(scPhospho-proteomics)正在逐步開展,預計將揭示細胞信號通路在動態調控過程中的關鍵節點。
3、與多組學和空間信息的融合
SCP的未來不僅是“單點突破",而是朝著多維整合方向演進:
單細胞多組學:與scRNA-seq、scATAC-seq等數據聯合建模,實現從轉錄到蛋白的全鏈條理解;
空間蛋白組學整合:與空間轉錄組學、組織成像數據融合,描繪組織結構中的蛋白表達與功能圖譜;
動態蛋白組學分析:在時間維度上監測細胞狀態轉變過程,揭示dànbáizhì動態調控機制。
這種融合將為個體化醫學和系統生物學提供更完整、精細的分子圖譜。
4、向臨床轉化方向靠攏
雖然當前SCP應用多集中在基礎研究領域,但隨著平臺穩定性提升和數據解讀算法成熟,臨床應用前景逐步顯現:
耐藥監測與療效評估:通過分析腫瘤組織中單細胞蛋白狀態變化,輔助個性化治療決策;
miǎnyìzhìliáo響應預測:解析T細胞功能狀態,發現免疫激活與抑制信號的關鍵蛋白指標。
在法規、樣本規范化、數據標準等配套機制完善后,SCP有望成為jīngzhǔn醫療中的重要支撐技術。
單細胞dànbáizhì組學正處于從方法驗證向廣泛應用轉型的關鍵階段。隨著質譜靈敏度不斷提高、樣品處理系統日益成熟、數據算法持續優化,單細胞dànbáizhì組學將逐步擺脫“高門檻、低通量"的局限,走向高通量、多維度、標準化的應用新格局。未來,單細胞dànbáizhì組學將在揭示疾病機制、推動靶點發現、實現個性化診療等方面發揮越來越重要的作用。在這一快速演進的領域,百泰派克生物科技密切跟蹤SCP的前沿動態,致力于為科研人員提供優良、可靠的單細胞dànbáizhì組學分析服務。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
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