質(zhì)譜在單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用與優(yōu)勢(shì)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

生命科學(xué)研究不斷邁向單細(xì)胞層面，單細(xì)胞dànbáizhì組學(xué)（single-cell proteomics, SCP）正成為揭示細(xì)胞異質(zhì)性、解析復(fù)雜生物過(guò)程的重要工具。盡管單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組已廣泛應(yīng)用，但由于mRNA水平與蛋白表達(dá)之間并不總是高度相關(guān)，直接在蛋白水平上進(jìn)行測(cè)量對(duì)于理解真實(shí)的細(xì)胞功能狀態(tài)至關(guān)重要。

質(zhì)譜（mass spectrometry, MS）作為高通量、無(wú)偏倚的dànbáizhì分析平臺(tái)，近年來(lái)在單細(xì)胞dànbáizhì組學(xué)領(lǐng)域取得了顯著突破。百泰派克生物科技依托優(yōu)良的質(zhì)譜平臺(tái)與優(yōu)化的樣本前處理流程，為科研人員提供高靈敏、高重復(fù)性的單細(xì)胞蛋白組解決方案，助力探索“一個(gè)細(xì)胞的世界"。

一、單細(xì)胞dànbáizhì組學(xué)的技術(shù)挑戰(zhàn)

與dànbáizhì組學(xué)相比，單細(xì)胞分析面臨諸多技術(shù)瓶頸：

1、樣本量極低：?jiǎn)蝹€(gè)哺乳動(dòng)物細(xì)胞中僅含約200–300 pg蛋白，總量遠(yuǎn)低于常規(guī)質(zhì)譜所需的ng級(jí)別。

2、信號(hào)噪聲比低：背景雜質(zhì)、載體蛋白污染易掩蓋低豐度蛋白的真實(shí)信號(hào)。

3、批次效應(yīng)顯著：微量操作對(duì)實(shí)驗(yàn)重復(fù)性和定量準(zhǔn)確性提出更高要求。

為解決上述問(wèn)題，科研界發(fā)展出一系列創(chuàng)新策略，如納升級(jí)液相色譜（nanoLC）、超靈敏質(zhì)譜儀（如Orbitrap Eclipse、timsTOF SCP）、基于TMT的載體標(biāo)簽策略（boosting）等。

二、質(zhì)譜技術(shù)如何賦能單細(xì)胞dànbáizhì組學(xué)

1、極限靈敏度分析能力

近年來(lái)質(zhì)譜儀的靈敏度和掃描速度大幅提升，使其具備檢測(cè)單細(xì)胞水平dànbáizhì的能力。例如，Thermo Scientific 的 Orbitrap Exploris 系列結(jié)合 FAIMS 技術(shù)，可在控制背景干擾的同時(shí)實(shí)現(xiàn)低豐度蛋白的高置信度鑒定。百泰派克生物科技在單細(xì)胞蛋白組項(xiàng)目中配備Orbitrap Eclipse Tribrid平臺(tái)，結(jié)合低損耗納流色譜和zhuānlì級(jí)前處理技術(shù)，可實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞級(jí)別的300–1000種dànbáizhìjīngzhǔn定量。

2、TMT標(biāo)簽+載體通道策略提升定量深度

基于TMT（Tandem Mass Tag）的多重標(biāo)記策略，研究者可同時(shí)分析多個(gè)單細(xì)胞樣本，并通過(guò)加入“載體通道"（carrier channel）引入富集的同源細(xì)胞蛋白以增強(qiáng)信號(hào)，從而在不犧牲單細(xì)胞定量精度的前提下提升鑒定數(shù)量。例如，SCoPE-MS、SCoPE2、plexDIA等方法均基于此策略，現(xiàn)已成為單細(xì)胞質(zhì)譜領(lǐng)域的重要里程碑。百泰派克生物科技開(kāi)發(fā)的“低損耗-TMT定量平臺(tái)"，可根據(jù)項(xiàng)目需求自定義TMTplex組合，實(shí)現(xiàn)zuì優(yōu)信噪比與通量的平衡。

3、數(shù)據(jù)分析與算法驅(qū)動(dòng)定量?jī)?yōu)化

單細(xì)胞蛋白組學(xué)的定量結(jié)果對(duì)數(shù)據(jù)處理算法極度依賴(lài)。采用合適的歸一化、去噪與缺失值處理策略可顯著提高分析可信度。常用的分析工具包括：

（1）DART-ID：通過(guò)保留時(shí)間校準(zhǔn)提高鑒定率

（2）MaxQuant + Perseus：標(biāo)準(zhǔn)化質(zhì)譜定量分析流程

（3）MSstats：適用于處理低復(fù)制和缺失值頻繁的數(shù)據(jù)

百泰派克生物科技在交付服務(wù)中配套提供定制化數(shù)據(jù)分析流程，包括細(xì)胞簇分類(lèi)、功能富集分析、蛋白表達(dá)熱圖等，幫助研究者jīngzhǔn解讀單細(xì)胞層面的生物學(xué)意義。

三、應(yīng)用場(chǎng)景廣泛的單細(xì)胞dànbáizhì組學(xué)

1、腫瘤異質(zhì)性分析

腫瘤組織中的細(xì)胞具有高度異質(zhì)性。通過(guò)單細(xì)胞dànbáizhì組分析，可識(shí)別不同亞群的蛋白表達(dá)模式，揭示藥物耐受機(jī)制、轉(zhuǎn)移潛能及免疫逃逸通路。

2、免疫細(xì)胞分型與功能分析

在免疫學(xué)研究中，單細(xì)胞質(zhì)譜可用于解析T細(xì)胞、B細(xì)胞、巨噬細(xì)胞等的活化狀態(tài)與功能差異，彌補(bǔ)流式細(xì)胞術(shù)標(biāo)記位點(diǎn)有限的不足。

3、干細(xì)胞分化與再生研究

追蹤干細(xì)胞分化過(guò)程中蛋白組的動(dòng)態(tài)變化，有助于揭示細(xì)胞命運(yùn)決定與組織再生的分子機(jī)制。

4、藥物篩選與機(jī)制驗(yàn)證

單細(xì)胞蛋白組技術(shù)可用于高內(nèi)涵篩選（high-content screening），監(jiān)測(cè)藥物對(duì)不同細(xì)胞群體的特異性作用，輔助jīngzhǔn治療開(kāi)發(fā)。

百泰派克生物科技：您在單細(xì)胞蛋白組研究中的可信伙伴

百泰派克生物科技整合國(guó)內(nèi)lǐngxiān的質(zhì)譜儀群、自動(dòng)化前處理設(shè)備與zīshēn生信團(tuán)隊(duì)，為單細(xì)胞研究者提供一站式解決方案，包括：

（1）超微量樣本制備優(yōu)化服務(wù)

（2）多通道TMT標(biāo)記與高靈敏質(zhì)譜分析

（3）高通量數(shù)據(jù)處理與可視化報(bào)告

（4）定制化科研支持與技術(shù)咨詢(xún)

質(zhì)譜技術(shù)正推動(dòng)dànbáizhì組學(xué)邁入單細(xì)胞時(shí)代，其在靈敏度、通量和數(shù)據(jù)深度上的突破使科研人員能以qiánsuǒwèiyǒu的視角觀察細(xì)胞行為。面對(duì)生命科學(xué)研究對(duì)精細(xì)化的不斷追求，單細(xì)胞蛋白組學(xué)無(wú)疑是下一個(gè)戰(zhàn)略高地。百泰派克生物科技已為多個(gè)高校、醫(yī)院與生物醫(yī)藥企業(yè)提供單細(xì)胞dànbáizhì組學(xué)項(xiàng)目支持，歡迎聯(lián)系獲取免費(fèi)評(píng)估與技術(shù)方案。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線(xiàn)性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專(zhuān)有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶(hù)提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶(hù)提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿(mǎn)足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶(hù)的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

質(zhì)譜在單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用與優(yōu)勢(shì)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹