De Novo單克隆抗體測序：技術解析、優勢與應用檢測技術服務詳情介紹

一、什么是De Novo單克隆抗體測序？

De Novo抗體測序是指不依賴參考數據庫，通過高分辨率質譜（LC-MS/MS）對酶解抗體肽段進行MS/MS碎片分析，利用算法從碎片峰圖中逐步推斷氨基酸序列，并拼接出完整的單克隆抗體序列的技術。

與傳統的數據庫比對型測序不同，De Novo測序不需要任何已知基因信息或參考序列，它wánquán從蛋白出發，向結構還原。尤其在抗體中，zuì關鍵的區域是可變區（Variable region）中的互補決定區（CDR），而這些序列恰恰在公共數據庫中難以查找，因此只有De Novo測序能夠真正實現高變異性抗體的結構解析。

在完整流程中，一項高質量的單克隆抗體De Novo測序項目通常包括以下幾個步驟：

• 抗體蛋白樣本純化與質控；

• 多酶酶解（Trypsin、Chymotrypsin等）生成高覆蓋肽段；

• 高分辨率質譜采集肽段的碎片圖譜；

• 使用De Novo算法（如PEAKS、Novor）進行肽段序列推斷；

• 序列拼接與完整結構重建；

• 人工校對、修飾識別、建模比對與（可選）表達驗證。

二、技術優勢：為何選擇De Novo單克隆抗體測序？

1、不依賴基因，不受表達限制 許多抗體樣本（如臨床來源、動物免疫、第三方采購）無法獲取原始B細胞或表達載體，傳統基因測序方法無法開展。De Novo測序直接從蛋白出發，無需DNA/RNA信息，是

wéiyī適用的結構解析方式。

2、高度適應結構變異，覆蓋CDR等關鍵區域 抗體的可變區，尤其是CDR1~3區域，是功能位點的核心，但序列高度多變，幾乎難以在數據庫中找到匹配。De Novo測序基于碎片實際質量差推斷，

天然支持新變異、新結構識別，適合抗體工程設計與親和力改造研究。

3、可同時識別修飾信息，揭示抗體真實構象 抗體天然具有糖基化、脫酰胺、氧化等翻譯后修飾（PTMs），而這些修飾往往決定穩定性與功能。De Novo測序能在解析序列的同時，

同步捕捉修飾位點與修飾類型，揭示抗體在表達體系下的真實狀態。

4、可延伸為表達模板，用于結構復現 通過序列反向設計，De Novo結果可直接轉化為cDNA模板，實現抗體重組表達。適用于老抗體復現、功能驗證、結構建模與zhuānlì規避設計等需求。

三、實際應用場景：從科研探索到產業轉化

1、老抗體序列回溯

當實驗室已有一支功能抗體（來源未知/來源丟失），需用于重組表達或zhuānlì注冊，De Novo測序可還原完整結構，實現功能性“復刻"。

2、商業抗體比對與驗證

用于分析不同廠商生產的相同標號抗體是否真正一致，是否存在突變、修飾差異或批間變異。

3、抗體藥開發中的一致性研究

對抗體藥物在不同表達系統（如CHO vs HEK293）、不同工藝條件下的產物進行結構比對與一致性評估，滿足IND/BLA申報材料要求。

4、抗體zhuānlì設計與規避

基于De Novo結果識別已授權抗體藥的結構特征，設計具有序列差異而功能相近的“繞開型抗體"，輔助新藥研發中的IP策略規劃。

5、疫苗或免疫研究中的抗體篩選

從動物免疫血清中，通過De Novo單克隆抗體測序挖掘出高親和抗體的關鍵CDR序列，用于重組篩選與親和力成熟。

四、百泰派克生物科技的De Novo抗體測序解決方案

在百泰派克，我們構建了一套專注于抗體級別結構解析的De Novo平臺，結合實驗策略、數據處理與生物信息一體化交付，確保每一例項目都具備高覆蓋、高準確度、高可重組性。

1、多酶并行酶解設計：提升CDR等“難覆蓋區域"識別能力；

2、雙平臺質譜采集（Orbitrap × timsTOF）：兼顧分辨率與通量；

3、自主拼接算法 + 手工復核機制：保障序列準確性；

4、修飾識別、結構建模、差異比對等增值模塊：支持從研究到IND申報；

5、可選CHO表達驗證服務：從蛋白到功能的閉環交付。

我們已成功為抗體藥企、研究型醫院、疫苗企業及高校課題組，完成數百例抗體結構解析與表達項目，廣泛應用于老抗體復現、藥物一致性比對、結構差異分析、免疫譜篩選等任務中。

在抗體功能明確但序列未知的場景中，De Novo單克隆抗體測序為結構重建提供了一條切實可行、科學高效的路徑。它不止解決了“序列可得"的問題，更幫助研究者向“結構可控、表達可復現、zhuānlì可規劃"的目標邁進一步。如果你手中有無法追溯序列來源的抗體樣本，或者你正處于抗體表達、重構或一致性研究階段，De Novo抗體測序都值得納入你的核心技術選項。歡迎聯系百泰派克技術團隊，獲取樣本評估、項目方案與參考報告。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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