無標記定量蛋白質組學工具檢測技術服務詳情介紹

無標記定量dànbáizhì組學（Label-Free Quantitative Proteomics, LFQ）技術，憑借其樣本準備簡便、適用范圍廣泛、無標簽干擾等優勢，正逐漸成為生命科學研究中重要的定量手段。尤其在系統生物學、疾病機制研究、生物標志物篩選及藥物研發等領域，無標記定量策略正發揮著越來越重要的作用。本文將系統解析主流無標記定量dànbáizhì組學工具的原理與特點，探討其在實際科研中的優勢與挑戰。

一、無標記定量的基本原理

無標記定量主要依賴質譜信號強度（MS1級別）或譜圖計數（Spectral Counting）來間接衡量dànbáizhì的豐度變化。相比于同位素標記法（如SILAC、TMT等），LFQ無需在樣本處理階段引入化學或代謝標簽，操作流程更為簡潔。

※ 主流定量策略包括：

• MS1強度積分（Intensity-based LFQ）：通過提取肽段離子在MS1譜圖中的峰面積，計算不同樣本中同一肽段的信號強度變化，從而實現dànbáizhì水平的相對定量。

• 譜圖計數（Spectral Counting）：統計質譜中被鑒定的與某蛋白對應的肽段次數，適用于粗略定量，但對低豐度蛋白敏感性較差。

在實際應用中，MS1強度法因其較高的動態范圍與靈敏度，已成為主流選擇。

二、主流無標記定量工具及算法比較

隨著dànbáizhì組學分析需求的增長，多種面向LFQ的數據處理工具和算法應運而生。以下為目前廣泛應用的幾類代表性軟件：

1、MaxLFQ

• 開發背景：MaxLFQ是整合于MaxQuant軟件中的一種MS1強度定量算法，采用延遲歸一化與zuì小二乘法計算模型，提升了肽段間的比較準確性。

• 優勢：適用于大規模樣本分析，支持多條件實驗設計；具有較強的抗批次效應能力。

• 應用場景：常用于基礎研究、疾病模型蛋白差異分析。

2、Progenesis QI for Proteomics

• 特點：注重峰識別與對齊過程的jīngquè性，特別適合高復雜度樣本的分析。

• 優勢：圖形化界面友好，便于數據質量評估；對低豐度蛋白表現較好。

• 限制：對硬件配置和數據體量有較高要求。

3、MSstats

• 背景：基于R語言開發，適配多種質譜平臺輸出，采用線性模型（linear mixed models）處理數據。

• 優勢：支持統計假設檢驗、批次校正與缺失值*；易于與生信流程對接。

• 應用拓展：被廣泛用于臨床樣本、組學整合分析項目中。

4、DIA-NN（適用于DIA無標記數據）

• 技術特點：融合神經網絡算法與機器學習優化的定量精度，適用于數據獨立采集（DIA）模式。

• 優勢：處理速度快，適應高通量需求；兼容譜庫及無譜庫搜索。

• 未來潛力：DIA-NN等工具正在推動無標記定量從DDA向DIA的躍遷。

三、無標記定量的優勢與挑戰

※ 優勢

• 無需標記成本，樣本處理簡便：尤其適合難以進行標記處理的臨床樣本，如組織切片、血漿等。

• 適用范圍廣：理論上可用于任意數量樣本的比較，利于生物重復設計。

• 避免標記偏差：不存在標簽效率、摻雜干擾等問題。

※ 挑戰

• 重復性依賴質譜平臺穩定性：不同批次、不同儀器間的漂移會影響結果一致性。

• 數據缺失問題：低豐度肽段易受識別限制，導致數據缺失和定量偏差。

• 對前處理和對齊算法依賴高：樣本間對齊與峰提取質量直接影響定量精度。

四、如何提升LFQ數據的質量和解釋力？

為了提升無標記定量結果的可信度，建議從以下幾個維度進行優化：

• 實驗設計：控制變量清晰，盡量提高生物重復數量；

• 樣本處理一致性：標準化蛋白提取、消化與上樣流程；

• 質譜平臺選擇：優先選擇高分辨率、低漂移的系統；

• 數據分析策略：采用成熟穩定的軟件工具，配合多重統計方法交叉驗證；

• 功能富集與通路分析：結合GO、KEGG等數據庫，深入挖掘dànbáizhì功能變化。

無標記定量dànbáizhì組學，以其高靈活性、低成本和廣泛適用性，已成為當代生命科學研究的重要技術手段。隨著算法優化與質譜平臺不斷升級，其精度和通量正在不斷提高。百泰派克生物科技提供一站式基于Label Free的定量蛋白組分析服務，包括樣本處理、質譜分析、定量統計和生物信息解讀，助力科研團隊深入洞察生物體系中的動態變化。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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