靶向蛋白質(zhì)組學(xué)的現(xiàn)狀、挑戰(zhàn)及發(fā)展趨勢檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

隨著蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的持續(xù)進(jìn)步，研究重心正逐步從“發(fā)現(xiàn)型"（Discovery）方法向“靶向型"（Targeted）策略過渡。靶向蛋白質(zhì)組學(xué)，尤其是多反應(yīng)監(jiān)測（Multiple Reaction Monitoring, MRM/SRM）與并行反應(yīng)監(jiān)測（Parallel Reaction Monitoring, PRM）技術(shù)，已成為疾病標(biāo)志物驗(yàn)證、藥物靶點(diǎn)確認(rèn)及生物治療響應(yīng)評估等關(guān)鍵研究中的核心工具。本文將系統(tǒng)梳理靶向蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展現(xiàn)狀、面臨的主要技術(shù)挑戰(zhàn)及未來趨勢，并介紹百泰派克生物科技在該領(lǐng)域提供的全流程技術(shù)服務(wù)與解決方案。

一、什么是靶向蛋白質(zhì)組學(xué)？

靶向蛋白質(zhì)組學(xué)是一種基于質(zhì)譜的jīngquè定量策略，旨在通過預(yù)設(shè)目標(biāo)蛋白及其特征肽段，jīngzhǔn監(jiān)測其在不同樣本中的豐度變化。相較于數(shù)據(jù)依賴型采集（Data-Dependent Acquisition, DDA），靶向方法在靈敏度、動態(tài)范圍和重復(fù)性方面具備顯著優(yōu)勢。

1、核心技術(shù)路徑：MRM與PRM

（1）MRM（Multiple Reaction Monitoring）：依賴于三重四極桿質(zhì)譜，對目標(biāo)肽段的前體離子和特定碎片離子對進(jìn)行監(jiān)測，已廣泛應(yīng)用于臨床驗(yàn)證研究。

（2）PRM（Parallel Reaction Monitoring）：通常基于Orbitrap或Q-TOF質(zhì)譜平臺，獲取完整的MS/MS譜圖，特異性更高，適用于復(fù)雜樣本背景。

百泰派克生物科技配備多型號gāoduān質(zhì)譜平臺（包括QTRAP 6500+、Orbitrap Exploris 480等），結(jié)合自主優(yōu)化的靶向檢測流程，提供高通量、高準(zhǔn)確度的蛋白質(zhì)定量服務(wù)。

二、當(dāng)前應(yīng)用現(xiàn)狀

1、生物標(biāo)志物驗(yàn)證

相比Discovery階段篩選出的“候選蛋白"，靶向蛋白質(zhì)組學(xué)可實(shí)現(xiàn)其在獨(dú)立大樣本隊(duì)列中的準(zhǔn)確定量。例如，靶向檢測血清中的特定炎癥因子可輔助早期診斷類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎。

2、藥物作用機(jī)制與伴隨診斷

通過靶向量化治療前后關(guān)鍵信號通路蛋白的變化，研究人員能夠深入理解藥物機(jī)制，為新藥開發(fā)及個(gè)體化治療提供支持。

3、疫苗與免疫反應(yīng)評估

在疫苗開發(fā)中，PRM技術(shù)已被用于追蹤抗原暴露后免疫通路中關(guān)鍵蛋白的動態(tài)變化。

三、技術(shù)瓶頸與挑戰(zhàn)

1、靶標(biāo)蛋白的選擇與肽段設(shè)計(jì)

有效靶點(diǎn)需滿足可離子化、穩(wěn)定性強(qiáng)、不易發(fā)生翻譯后修飾干擾等條件。肽段設(shè)計(jì)的偏差可能直接影響定量效果。

2、標(biāo)準(zhǔn)品的制備

高質(zhì)量穩(wěn)定同位素標(biāo)記肽（SIS）是靶向定量的關(guān)鍵，但其制備成本高、覆蓋率有限，限制了靶向蛋白質(zhì)組學(xué)的大規(guī)模推廣。

3、數(shù)據(jù)處理復(fù)雜度高

PRM技術(shù)雖然提高了特異性，但同時(shí)也帶來了海量數(shù)據(jù)處理挑戰(zhàn)，需借助專門算法如Skyline、SpectroDive等進(jìn)行jīngzhǔn定量。

四、發(fā)展趨勢與未來方向

1、走向臨床、走向自動化

（1）從實(shí)驗(yàn)室走向臨床：隨著監(jiān)管規(guī)范逐步明晰，MRM方法已被納入部分FDA批準(zhǔn)的體外診斷試劑盒中，推動蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)向臨床常規(guī)檢測邁進(jìn)。

（2）自動化與AI輔助分析：人工方法已難以應(yīng)對大規(guī)模靶向項(xiàng)目，未來將依賴更多基于AI的分析平臺實(shí)現(xiàn)從方法開發(fā)到報(bào)告解讀的全流程自動化。

2、DIA與靶向技術(shù)的融合

近年來，基于數(shù)據(jù)獨(dú)立采集（DIA）的靶向分析策略正在興起，如DIA-PRM混合工作流，結(jié)合了DIA的廣譜性與PRM的高特異性，具備更廣闊的應(yīng)用前景。

百泰派克生物科技的zhuānyè靶向解決方案

在靶向蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)方面，百泰派克生物科技已建立了從靶點(diǎn)篩選-肽段優(yōu)化-標(biāo)準(zhǔn)品定制-質(zhì)譜方法開發(fā)-數(shù)據(jù)分析的全流程解決方案。服務(wù)特色包括：

* 多平臺并行：涵蓋Triple Quad、Qtrap、Orbitrap多類型質(zhì)譜儀

• 高通量能力：支持一次性檢測上百個(gè)靶點(diǎn)

• 數(shù)據(jù)可追溯性：全流程質(zhì)控體系，滿足GLP/GCP標(biāo)準(zhǔn)

• 生信分析整合：提供功能富集、通路分析、網(wǎng)絡(luò)圖譜構(gòu)建等下游服務(wù)

靶向蛋白質(zhì)組學(xué)正成為連接基礎(chǔ)研究與臨床應(yīng)用的橋梁。隨著技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)化、平臺自動化及生物信息學(xué)的發(fā)展，其在轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、藥物開發(fā)和疾病診斷中的作用將愈加凸顯。百泰派克生物科技將持續(xù)深耕靶向質(zhì)譜技術(shù)，助力科研人員實(shí)現(xiàn)從“定性"到“jīngzhǔn定量"的飛躍。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析，N端測序，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的蛋白質(zhì)，提供基于從頭測序法的蛋白質(zhì)從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質(zhì)組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白質(zhì)組學(xué)、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)先進(jìn)，填補(bǔ)技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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