dànbáizhì組學是一門以dànbáizhì組為研究對象,旨在研究細胞、組織或生物體組成及其變化規律的學科。自從1975年O'Farrell和Klose等人建立雙向凝膠電泳技術(2-DE)以來,2-DE技術憑借其高靈敏度和高分辨率、便于計算機進行圖像分析處理、可以很好地與質譜分析等鑒定方法匹配等優點成為目前dànbáizhì組學研究的核心手段。
近年來,dànbáizhì組學的研究重點已從dànbáizhì的鑒定到量化轉移。定量的dànbáizhì組學研究可定義為多個樣品間dànbáizhì豐度相對差異的研究。盡管一些可選擇的或互補的dànbáizhì組學技術正在發展,如同位素親和標簽和多維dànbáizhì鑒定技術,但雙向電泳仍是當前僅有的可以同時分離大量的復雜的dànbáizhì混合物的關鍵技術。
傳統的雙向電泳2-DE在樣品制備、電泳條件及凝膠染色等方面難以保證wánquán一致,因此容易產生膠間差異。這種差異會導致試驗的重復性不佳,敏感度較低,甚至可能掩蓋真實的生物學差異或產生誤導性的假陽性結果。為了解決2-DE技術存在的缺陷,1997年Unlü et al提出了雙向熒光差異凝膠電泳(Two-dimensional fluorescence difference gel electrophoresis,2D-DIGE)。
2D-DIGE 技術的原理是先用不同的熒光染料標記dànbáizhì樣品,再使dànbáizhì變性,然后用固定pH梯度凝膠,根據dànbáizhì電荷差異分離出不同pH值的dànbáizhì帶,再將此膠條置于含SDS 的聚丙烯酰胺凝膠上,根據dànbáizhì分子量加以分離,并通過多通道激光掃描分析不同dànbáizhì的SDS-PAGE凝膠圖像。其主要步驟:用2種不同的熒光染料(Cy2、Cy3 或 Cy5)標記要比較的dànbáizhì樣品;等量均勻混合熒光標記后的樣品;使用相同的內標,將混合后的樣品經雙向凝膠電泳進行分離;在熒光顯微鏡下,用不同的激發波長來檢測電泳結果。
圖1. 2D-DIGE技術的一般流程
2D-DIGE相較于傳統的2-DE具有的顯著優勢:
采用熒光標記技術,能同時比較多個樣品,提高了實驗效率和準確性。
由于熒光標記的引入,使得dànbáizhì的分離和檢測更加jīngquè,可以檢測到更細微的dànbáizhì差異。
引入了內標,更好地消除了試驗的偶然誤差,避免了不同凝膠之間的差異,極大地提高了結果的準確性和可信度。
不需要進行電泳后的固定或脫色過程,減少了dànbáizhì特別是低分子量dànbáizhì的損失。
熒光信號的數字化處理使得數據的獲取和分析更加快速和準確。
百泰派克生物科技提供SDS-PAGE和2D-DIGE電泳服務,結合Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺與nanoLC-MS/MS納升色譜,為廣大科研工作者提供一站式dànbáizhì組定性及定量服務。
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