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什么樣的蛋白質結構可以泛素化

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什么樣的蛋白質結構可以泛素化檢測技術服務詳情介紹

泛素化是一種dànbáizhì翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM),它涉及將一個或多個泛素(Ubiquitin)dànbáizhì添加到底物蛋白上。泛素是一種小的調節(jié)性dànbáizhì,可以與其他dànbáizhì共價結合。泛素化可以影響dànbáizhì的降解、位置、活性以及dànbáizhì之間的相互作用。理解哪些dànbáizhì結構可以被泛素化需要從泛素化的機制和靶點特性入手。

泛素化修飾研究路線

圖1


泛素化的機制


  • 泛素激活:泛素首先通過泛素激活酶(E1)被激活,并與之形成高能硫酯鍵。

  • 泛素結合:激活的泛素然后被轉移到泛素結合酶(E2)。

  • 泛素連接:泛素連接酶(E3)識別特定的底物蛋白,并協(xié)助將泛素從E2轉移到底物蛋白上。


可以泛素化的dànbáizhì結構:


1.靶位點特異性


  • 賴氨酸殘基(Lysine residues):泛素化zuì常見的靶位點是賴氨酸(Lysine,K)殘基。泛素的C末端gānānsuān與賴氨酸的側鏈氨基形成共價鍵。

  • 其他殘基:雖然賴氨酸是zuì常見的靶點,但泛素也可以連接到其他氨基酸殘基,如sīānsuān、sūānsuān和半guāngānsuān


2.泛素化位點序列:

某些dànbáizhì序列比其他序列更容易被泛素化。雖然沒有juéduì的序列特異性,但是研究顯示含有特定序列的肽段(如PXXLXQ)容易與E3泛素連接酶結合,促進泛素化。


3.結構的可及性:

dànbáizhì的三級結構會影響特定賴氨酸殘基的可及性。只有當E2泛素結合酶和E3泛素連接酶可以接觸到這些殘基時,泛素化才能發(fā)生。


4.dànbáizhì的柔性和動態(tài)性:

柔性較高的區(qū)域或者結構上具有一定動態(tài)性的dànbáizhì部分更容易發(fā)生泛素化,因為它們能夠更容易地適配于E2和E3酶的活性位點。


5.修飾的前體狀態(tài):

dànbáizhì的其他翻譯后修飾狀態(tài),如磷酸化、乙酰化等,有時可以增加dànbáizhì被泛素化的幾率,因為它們可以改變dànbáizhì的電荷、構象或者與E3泛素連接酶的親和力。


泛素化可以在多種不同類型的dànbáizhì結構上發(fā)生,但是這一過程往往偏好那些在空間結構上可以與E2和E3酶相互作用的賴氨酸殘基。dànbáizhì的泛素化狀態(tài)和功能受到其自身結構特征以及細胞環(huán)境中的多種因素的影響。

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