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自 1981 年作為日本微生物保藏中心 (JCM) 成立以來，RIKEN-BRC 的微生物部門一直在收集、保存和分發培養的微生物菌株，作為培養物保藏中心之一。 JCM 旨在通過維護為科學界做出貢獻為一般微生物研究和各種研究領域，特別是健康和環境科學領域提供高質量的微生物資源。 JCM作為“普通微生物"的核心設施參與了日本文部科學省支持的國家生物資源項目。 |
截至 2019 年 10 月，JCM 擁有約 29,000 株菌株，JCM 可用菌株的大致數量為：12,600 株包括放線菌在內的需氧和厭氧菌、560 株古細菌和 6,200 株包括酵母菌在內的真菌（總共約19,300 株）。 JCM 持有的菌株僅限于分類為風險組 1 或 2 的菌株。可用菌株的信息通過 JCM 在線目錄
數據庫向公眾開放。一些菌株的基因組DNA樣本也與RIKEN BRC-DNA Bank合作分發。每年向國內外研究人員分發4000余株。 JCM 正在努力不斷改進作為微生物資源中心的功能，開發新的微生物資源，描述新的微生物分類群，并開發調查和處理微生物、尚未培養的微生物和微生物群落的方法。 JCM的質量管理體系已獲得ISO 9001：2015認證，以保持和提高其服務質量。為了推廣微生物菌株的使用，JCM定期發布郵件新聞和通訊（日文），并提供基礎和高級微生物技術培訓課程。 |
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