人間充質干細胞定量聚合酶鏈反應 （qPCR） 芯片設計用于表征人間充質干細胞和祖細胞 （MSC） 及其分化的成軟骨細胞、成骨后代或成骨后代。MSC 是自我更新的多能前體，存在于多個組織的骨髓和基質隔室的貼壁部分中。MSC 可以在體外擴增以產生間充質基質細胞培養物，在適當的條件下，它可以分化為脂肪細胞、軟骨細胞和成骨細胞。該 qPCR 芯片提供體外分化后 MSC 及其三系衍生物的基因表達譜。根據基因在 MSC （Silva et al.） 或 MSC 衍生的軟骨形成 （Herlofsen et al.;Yoo 等人）、成脂 （Hung 等人;Menssen 等人）或成骨譜系細胞（Kulterer 等人）。

qPCR 用于確定多個樣品中基因表達的穩態 mRNA 水平的變化，通常歸一化為內部對照基因的相對表達。基因特異性引物可擴增從 mRNA 逆轉錄的 cDNA 庫中的靶序列，并且與 TaqMan® 技術一樣，雜交序列特異性探針提供來自 Taq DNA 聚合酶的 5' 核酸外切酶活性的熒光信號。熒光信號的積累速率用于定量樣品 cDNA，從而定量原始細胞裂解物中 mRNA 的量。

該 qPCR 芯片包含經驗證的引物和探針，用于檢測 90 個表達與 MSC 或其分化衍生物相關的基因，以及 6 個內源性（管家）對照基因。TBP（TATA 盒結合蛋白）qPCR 對照模板作為合成 DNA 陽性對照提供。