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蔗糖是由葡萄糖和果糖通過異構體羥基縮合而成的非還原性二糖。蔗糖極易溶于水其溶解度隨著溫度的升高而增大。蔗糖的化學性質穩定，多呈無定型結構，對阻止蛋白質二級結構改變、凍干處理過程中，貯藏期內蛋白質的伸展和聚集起重要的作用。糖對蛋白質保護作用大小有時和其濃度有關，通常在某個濃度范圍內糖的保護作用隨著濃度的升高而增大；當達到某一濃度時保護作用達到大值，而此后再增大糖的濃度則保護效果不再顯著增加，有時反而會降低。在凍干時，其中蔗糖 海藻糖等雙糖對一些蛋白質均能顯示出良好的保護作用，具備多種保護特性，如高的玻璃化溫度， 低的吸濕性能 ，低的結晶速率 及不具有還原性基團等。但任何單一保護劑都不可能具有所有的保護特性，因此有時還得考慮使用2種或2種以上的保護劑來穩定蛋白質藥物。熒光PCR凍干時可采用的凍干保護劑有：海藻糖、蔗糖、甘露醇、PEG、pvp等。但是除了這些常用的還有很多如甘油、乳糖、半乳糖、組氨酸、精氨酸、甘氨酸、右旋糖苷、吐溫80、吐溫100、環糊精、明膠、維生素C、維生素B、牛血清、二硫蘇糖醇、吐溫20、明膠等，這些都是很好的凍干保護劑或者賦形劑。因此對于同一個試劑的凍干可以選擇的凍干保護劑是很多的。