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首先用導線將電泳槽的兩個電極與電泳儀的直流輸出端聯接，注意極性不要接反。電泳儀電源開關調至關的位置，電壓旋鈕轉到最小，根據工作需要選擇穩壓穩流方式及電壓電流范圍。接通電源，緩緩旋轉電壓調節鈕直到達到的所需電壓為止，設定電泳終止時間，此時電泳即開始進行。工作完畢后，應將各旋鈕、開關旋至零位或關閉狀態，并撥出電泳插頭。
電泳儀注意事項：
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