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多層薄膜通常用于食品和藥品的包裝袋。用以測量每層薄膜的成分的最常見方法是，將薄膜切出橫截面，利用紅外顯微透射法對所得試樣進行測量。使用這種方法時，如果薄膜的厚度為10μm或以上，那么可以測量出每層薄膜的光譜。

在此實例中，利用切片機對本試樣進行切割，切割厚度為10μm。將切割后的橫截面放置在金剛石透射池上，然后進行擠壓，最后利用紅外顯微鏡進行測量。圖1展示的是在擠壓前的橫截面的放大圖。圖2是擠壓后橫截面的放大圖。圖2中7層薄膜的光譜參見圖3。基于每個光譜的吸收特性，第1層薄膜可能是聚對苯二甲酸乙酯；第2、6、7層薄膜可能是聚乙烯；第3層薄膜可能是尼龍；第4和5層薄膜可能是乙烯-醋酸乙烯酯。

FTIR紅外光譜儀的主要用途是估計有機化合物的結構。該儀器將紅外光線照射在分子上，分子吸收紅外輻射（相當于組成這些分子的原子之間的振動能量），然后對其結構進行估計，最后通過紅外吸收的方法對該化合物做出定量分析。

將紅外顯微鏡與FTIR光譜儀聯用，甚至可以測量出大約10μm的微小污染物。