對于含有水的樣品，如果含水量不是很大，一般是可以用氣相色譜檢測樣品含量。
及時是少量的水也會對氣相色譜儀器造成一定的影響。主要影響如下:
1、很多檢測器是怕水的，如 ECD、MSD 和 NPD，大量水蒸汽的進入會導致這些檢測器的性能下降，水進樣量較大時還容易使 FID 火焰熄滅。TCD熱導檢測器不會因為水的存在而有損壞。
2、很多毛細柱也是怕水的。水的表面能很大, 而大部分的毛細管柱固定相的表面能較低, 導致水的潤濕性能很差.嚴重影響峰形。
分析樣品需采用氣相色譜法時，如何避免水對檢測器和柱子造成的影響？
1、盡量不要選用水作為樣品溶劑
2、水作為溶劑時，可選用耐水的檢測器。
3、選擇不怕水的色譜柱，有機多孔聚合物類型的色譜柱（如 PLOT Q 或 U）有良好的耐水性，因此 PLOT 色譜柱能否進水樣請具體參照廠家的建議
4、建議使用大體積的襯管 (≥900μl) 和小的進樣量 (≤0.5ul) 來避免襯管超載
5、設置溫度上，如果初始溫度低于 100℃，建議定期以 200℃ 烘烤柱子（需低于柱子zuiGAO使用溫度）
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