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超高效液相系統耐壓更高，可以以更高的流速進行分析，并且在高流速下仍能保持很好的理論塔板數。
高效指的就是效率更高，即在同樣的時間內可以分析更多的樣品。高效液相色譜是相對經典液相色譜來說的，高效液相色譜具有更細的流動相傳輸管路，內徑更細的色譜柱，從而使死體積變小，理論塔板數更高，分析時間更短。超高效就是通過提高流速來減小出峰時間，縮短樣品流出速度，從而提高單針的分析時間來實現比高效液相更加“高效"的。
超高效液相需要整個液相色譜系統，包括色譜柱都具有很高的耐壓能力，故其所用的配件和色譜柱一般均為專用，不可用高效液相色譜柱代替。