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 　科學家們已經知道，如果病毒的某些蛋白質碰巧類似于正常的人類蛋白質，那么病毒感染可以導致自身免疫。針對病毒的抗體最終也會與正常的人類細胞發生反應。研究人員發現，患有胃炎的小鼠產生了對抗胃細胞蛋白質的抗體。但他們也研制出了對抗多種與其他自身免疫疾病相關的正常蛋白質的抗體。此外，他們有許多針對身體自身正常蛋白質的T細胞，以及T細胞群的其他變化，使免疫系統偏向于自身免疫。