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原代細胞分析之全攻略

時間:2018/6/14閱讀:668
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原代細胞轉錄組學和蛋白質組學NanoString Technologies的科學家發現,細胞群體的RNA平均表達水平不一定與群體中單個細胞的RNA表達相同。例如,有些基因持續在低水平表達,而另一些則在短時間內大量表達。對宏觀測定而言,這樣的表達模式被平均化。

該公司*的數字表達譜分析系統能直接對單個RNA分析進行計數,zui多可分析單細胞中的800個不同分子。這是利用nCounter Single Cell Gene Expression Assay中的分子條形碼來實現的,它識別特定的RNA分子。單細胞樣品在裂解后,經過逆轉錄和預擴增,隨后與分子條形碼雜交,純化后在nCounter®分析儀上讀取。

哈佛大學的Hongkun Park研究小組與Broad研究院的Aviv Regev研究小組合作,來研究看似均質細胞中的基因表達異質性1。Park、Regev及其同事利用一種稱為Smart-Seq的技術,來讀取RNA轉錄本的覆蓋。與原先的RNA-Seq方法相比,Smart-Seq讓研究人員能夠更詳細了解mRNA選擇性剪接所產生的異構體,同時更好地鑒定單核苷酸多態性(SNP)。

通過計算機分析,Regev和Park發現,mRNA豐度和剪接模式都存在之前未觀察到的雙峰(bimodal)變化,并通過RNA-熒光原位雜交(FISH)對精選轉錄本進行了驗證。如今,他們正在擴展樣品類型。Park談道:“目前我們正將原代細胞RNA-Seq方法應用在各種免疫細胞、神經細胞和癌癥細胞上,以便了解驅動細胞之間變化的因素、這種變化的動力學及其生物學影響。”

 H-ras/Ras/Ras p21 磷酸化周期素E抗體

 Hrasls3/HREV107 磷酸化周期素E抗體

 HRG Beta1 磷酸化周期素B1抗體

 HRG-alpha 磷酸化周期素B1抗體

 HRH3/GPCR97 磷酸化周期素B1抗體

 HRH4/GPCR105 磷酸化周期素B1抗體

 HSA 磷酸化周期蛋白依賴激酶抑制因子1C抗體

 HSA 磷酸化腫瘤易感候選基因3抗體

 HSA 磷酸化腫瘤抑制基因PTEN抗體

 HSD11B1/HSD1 磷酸化腫瘤抑制基因PTEN抗體

 HSD11B2/HSD2 磷酸化腫瘤抑制基因P53抗體

 HSD17B1 磷酸化腫瘤抑制基因P53抗體

 HSD17B2 磷酸化腫瘤抑制基因P53抗體
原代細胞

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