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1848次細胞進行免疫熒光染色，主要有兩種方法：直接法和間接法。
1.直接免疫熒光標記法的樣品制備取細胞(約1×106個／m1)，在每一管中分別加入適量熒光素標記的一抗，充分混勻(如做雙標或多標染色，可把幾種標記有不同熒光素的抗體同時加入)，孵育20～60min后，用PBS洗1～2次，離心收集細胞，加入緩沖液重懸，上機檢測。直接染色法抗體較貴，但操作簡便，結果準確，適用于同一細胞群多參數同時測定。
2．間接免疫熒光標記法的樣品制備取一定量的細胞懸液(約1×106個細胞／ml)，先加入特異的*抗體，待反應*后洗去未結合抗體，再加入熒光標記的第二抗體，生成抗原，抗體-抗抗體復合物，以FCM檢測其上標記的熒光素被激發后發出的熒光。本方法費用較低，二抗應用廣泛，多用于科研標本的檢測。但由于二抗一般為多克隆抗體，特異性較差，非特異性熒光背景較強，易影響實驗結果。所以標本制備時應加入陰性或陽性對照。另外，由于間接法步驟較多，增加了細胞的丟失，不適用測定細胞數較少的標本。
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