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多樣本直接PCR系列專題

2017-8-2  閱讀(1933)

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多樣本直接PCR系列專題

More Genotyping, Less Time and Fewer Reagents

PCR-based Genotyping等實驗,常需純化樣本基因組。當待測樣本較多時,純化基因組的過程費時、操作重復,并且實驗成本高。翊圣生物通過改造Taq DNA聚合酶,優化PCR反應體系開發出無需基因組純化的Direct PCR Kit系列產品。

Clever PCR:Direct PCR

翊圣Direct PCR Kit是直接從樣本開始,以未經基因組純化的微量原始樣本(圖1-A)或其裂解產物(圖1-B)作為模板,進行PCR-based Genotyping(見圖1)。與常規PCR-based Genotyping相比,Direct PCR Kit樣本用量少,操作簡單,實驗成本低,可高通量化樣本檢測。

 

圖1 Direct PCR技術 A. 直接法:取少量樣本直接加入到PCR Master Mix中,進行PCR鑒定。B. 裂解法:樣本取樣后,加入裂解液中,裂解釋放基因組,取少量裂解上清液加入到PCR Master Mix中,進行PCR鑒定。

技術優勢

★直接:無需進行費時而昂貴的DNA純化

★快速:10min完成模板制備,zui少50min完成PCR反應

★簡便:樣品無需剪碎或研磨即可完成裂解

        PCR Mix為預混液形式,減少加樣步驟

★節?。?/span>材料用量少

★高通量:可在96孔板中完成裂解反應

 

 

 

 

 

翊圣生物Direct PCR Kit

產品參數

Animal Tissue Direct PCR Kit

Mouse Tissue Direct PCR Kit

Plant Tissue Direct PCR kit

Animal Blood Dicrect PCR Kit

適用生物

小鼠、兔子、鳥類、淡水魚、果蠅線蟲、

小鼠、大鼠

水稻、玉米、煙草、油菜、小麥、大豆等

人血、鼠血、雞血、鳥血、牛血、狗血

適用組織/材料類型

腦、心臟、肝臟、胰臟、腎臟、脾臟、睪丸、肌肉、羽毛末端

鼠尾、鼠耳、腳趾(帶肌肉)和其他臟器

嫩葉、老葉、幼苗嫩莖

EDTA、Heparin抗凝全血、血液的采集卡、冷凍血和抗凝血等

樣品使用量

5-10mg

5-10mg

3-5mg(5-7mm),1-2mg(2-3mm)

人血2-45%;鼠血2-20%;采集卡1-4mm

基因組釋放時間

10-30min

10-30min

10min或無需專門裂解過程

無需專門裂解過程

PCR產物zui適長度

<1kb

PCR產物是否加A

裂解反應體系加A效率不定

50µL體系,裂解產物使用量

0.5-5µL

0.5-5µL

5-10µL

人血2-45%;鼠血2-20%;采集卡1-4mm

應用

轉基因鑒定基因分型等

轉基因鑒定、基因分型等

轉基因鑒定基因分型等

基因型病原微生物鑒定

Direct PCR Kit實驗過程

本系列產品運用*的蛋白酶裂解體系,裂解樣品,裂解液可直接作為模板,搭配試劑盒中的PCR Master Mix進行基因擴增。

 

圖2 動物、小鼠組織直接PCR實驗過程

 

圖3 動物全血直接PCR實驗過程

 

圖4 植物組織直接PCR實驗過程

產品優勢

Ø 改造的Taq DNA Polymerase是Direct PCR的保證:*的抑制物耐受性

對于非純化樣本作為模板時,會引入很多對PCR反應有抑制的成分。以普通的PCR反應體系和Taq DNA聚合酶較難得到理想的結果,甚至無法進行PCR擴增。本系列試劑盒中PCR Mix為配方優化預混液,采用改造的Taq DNA Polymerase,增加與模板DNA結合能力,對于常見PCR抑制劑具有更高的耐受性,因此具有更廣泛的模板適應性。

 

圖5 直接PCR Kit中的PCR Mix具有更高的雜質耐受度。相同模板量,用不同的PCR Mix進行PCR,同時在體系中加入不同濃度的各種PCR反應抑制物。比較不同條件下的PCR產物量。

 

 

 

 

 

 

翊圣生物針對不同樣本,開發出一系列產品

、多動物通用型Animal Tissue Direct PCR Kit

Ø zui快速:操作時間短

 

圖6 翊圣動物組織直接PCR試劑盒更加節省時間。

Ø  實驗例:基因敲除小鼠基因型鑒定

 

圖7 動物組織直接PCR試劑盒檢測基因敲除動物組織直擴結果。M:100bp DNA ladder。1-8:以裂解產物為模板。+:以50ng純化基因組DNA為模板。:以去離子水為模板。循環數:35個循環。單條帶(580bp):敲除動物純合子基因組。單條帶(180bp):野生型基因組。兩條帶(580bp/180bp):敲除動物雜合子基因組。

二、嚙齒類型:Mouse Tissue Direct PCR Kit

Ø 更快速:基因釋放充分

 

圖8 小鼠組織直接PCR試劑盒不同裂解時間直擴結果。M:100bp DNA ladder。+:以50 ng純化基因組DNA為模板。循環數:35個循環。

 

 

 

Ø 更*:基因釋放充分

1、優于常規堿裂解方法

 

圖9 鼠尾經不同裂解方式處理后,直擴結果。檢測基因:SOX21。M:100 bp DNA ladder。1-2:以常規堿裂解方式處理裂解產物為模板。3-4:以小鼠組織直接PCR試劑盒裂解產物為模板。+:以50 ng純化基因組DNA為模板。:以去離子水為模板。循環數:35個循環。

2、媲美同類產品

 

圖10 鼠尾經不同品牌同類產品裂解處理后,直擴結果。檢測基因:SOX21。M :100 bp DNA ladder。+ :以50 ng純化基因組DNA為模板。循環數:35個循環。

 

三、多動物通用型:Animal Blood Direct PCR Kit

Ø zui大模板耐受度:高達45%

 

圖11 不同體積的EDTA抗凝人血加入量,動物血液直接PCR試劑盒直擴結果。檢測基因:SOX2。M:DNA Marker I。循環數:30個循環。

 

 

 

四、植物類型:Plant Tissue Direct PCR Kit

Ø 多類型植物樣本驗證

 

圖12 不同類型植物葉片直擴結果。M:100 bp DNA ladder。C:相應植物純化基因組DNA為模板。1-2:葉片組織裂解產物為模板。循環數:30個循環。

客戶實驗

1、轉基因小鼠基因型鑒定

 

 

圖13青島大學用戶使用鼠尾直接PCR試劑盒擴增某基因結果。M:DNA marker II。1-12:轉基因小鼠鼠尾裂解液。13:陽性質粒對照。:以去離子水為模板。循環數:30個循環。

2、水稻基因直擴

 

圖14 華中農業大學用戶使用植物直接PCR試劑盒擴增水稻相關基因

 

訂購信息

產品貨號

產品名稱

規格

價格(元)

10180ES50

Animal Tissue Direct PCR Kit 動物組織直接PCR試劑盒

50 T

326.00

10180ES70

200 T

1236.00

10181ES50

Mouse Tissue Direct PCR Kit 小鼠組織直接PCR試劑盒

50 T

326.00

10181ES70

200 T

1236.00

10182ES50

Animal Blood Direct PCR Kit 全血直接PCR試劑盒

50 T

326.00

10182ES70

200 T

1236.00

10183ES50

Plant Tissue PCR Kit 植物組織直接PCR試劑盒

50 T

326.00

10183ES70

200 T

1236.00

 

 

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