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Topoisomerase I 助力5min完成克隆

2023-11-24  閱讀(266)

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拓撲異構酶(Topoisomerase) 是存在于細胞核內的一類酶,它們能夠切斷單鏈或雙鏈DNA的磷酸二酯鍵,然后重新纏繞和封口來更正DNA連環數,從而控制DNA的拓撲狀態。DNA拓撲異構酶分為兩類,I型DNA拓撲異構酶(DNA Topoisomerase I)和II型DNA拓撲異構酶(DNA Topoisomerase II)。
 
Topoisomerase I是由美國科學家Stewart Shuman在1990年從牛痘病毒中發現的,同時具有限制性內切酶活性和連接酶活性,能夠在DNA復制過程中切斷并重新連接DNA。Topoisomerase I可以在無需ATP供能的情況下切斷DNA鏈,在切割單鏈DNA后,會與末端DNA片段形成暫時性中間體,并在釋放壓力后重新連接切口。由于Topoisomerase I具有切斷、連接DNA的這種特性,常被用于克隆載體的構建(如TOPO克隆)以及NGS 建庫中的接頭連接等。

 


圖1. Topoisomerase I原理圖[1]

 

 
TOPO克隆
 
TOPO克隆是一種基于Topoisomerase I的PCR產物快速克隆系統,利用Topoisomerase I的連接原理,無需DNA連接酶,可在5 min內高效連接DNA片段。Topoisomerase I識別并切割TOPO載體上的結合位點,切割完成后,與TOPO載體結合形成復合物。目的DNA片段可在Topoisomerase I的作用下與TOPO載體連接,形成克隆。
 

技術路線

 

識別切割:Topoisomerase I識別DNA序列5’-(C/T)CCTT-3’,并且能夠在該位點對DNA進行切割;

 

固定:Topoisomerase I借助DNA斷裂的能量將酪氨酸殘基與載體DNA 3’末端形成共價鍵,從而固定在DNA載體上;

 

連接:在加入目的DNA片段(PCR Product)后,目的DNA片段的5'端羥基攻擊載體片段的磷酸鍵,釋放能量,使得目的DNA片段的 5'端羥基與載體片段的3'端磷酸基團連接在一起;

 

脫落:Topoisomerase I從載體分子上脫落。

 

圖2. TOPO原理圖

 

 
翌圣Topoisomerase I
 
翌圣Topoisomerase I (Cat#14971ES)由翌圣鎂孚泰生物ZymeEditor酶進化平臺經過重組表達獲得,無外切酶殘留、低宿主殘留,可應用于NGS 建庫中的接頭連接、TOPO克隆等!

 

 
部分數據展示
 
01

 

應用到TOPO克隆,克隆效果優于A品牌

 
 
使用不同批次的Topoisomerase I進行TOPO克隆,分別連接2 kb的粘性末端、4 kb的平末端,實驗結果表明,翌圣Topoisomerase I運用到TOPO克隆中,克隆效果優于A品牌,陽性克隆率達100%(8/8)。

 

圖3. Topoisomerase I運用到TOPO克隆效果圖

 

02

外切酶殘留

 
 
將50 U不同批次的Topoisomerase I分別與相應的底物DNA在37℃孵育4 h,瓊脂糖凝膠電泳檢測結果表明,翌圣Topoisomerase I無外切酶殘留。

圖4. 外切酶殘留檢測

 

03

E. coli基因組DNA殘留< 1 copy/5U

 
 
對不同批次的Topoisomerase I (Cat#14971ES)進行E. coli基因組DNA殘留檢測,結果顯示翌圣Topoisomerase I宿主基因組DNA殘留遠低于1 copy/5U。

圖5. E. coli基因組DNA殘留檢測

 

 

 
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產品名稱

產品貨號

產品規格

Topoisomerase I

14971ES

100 / 500 U



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