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隔水式恒溫培養箱箱體和外箱門采用鋼板、表面噴塑，箱門采用鋼化玻璃觀察窗，能清晰直接觀察箱內的培養物品，工作室（內膽）采用不銹鋼亞弧焊接制成，可任意改變擱板的高度。外門與箱體磁性門封條，以保證工作室的密封性。隔水式恒溫培養箱工作室采用“U"型水箱隔水加熱，箱體左上側有一加水口，左下側有一放水口，左背后有一溢水橡皮管。工作室后背裝有一只低噪聲小型風機，保證箱內溫度均勻性。隔水式恒溫培養箱箱體外殼和工作室間填充超細玻璃棉隔熱。

隔水式恒溫培養箱控溫系統由傳感器（Pt100鉑電阻）、溫度控制器、加熱器等組成，當溫度控制器接受傳感器輸出電阻信號（0℃時為100Ω，0.3Ω/℃）后，在PV屏顯示工作室內測量實際溫度，當輸入信號小于設定值時，功率管（雙向可控硅）導通，使加熱器獲得足夠的電功率產生熱量。反之，功率管無電功率輸出加熱器不加熱。隔水式恒溫培養箱溫度控制器具有PID調節輸出特性、電功率輸出大小可調、測量溫度的誤差校正、定時控制及改變等功能及超溫或高、低水位有燈光及自動切斷輸出報警的安全功能。