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人巨細胞病毒病毒基因組測序

時間:2013-6-24閱讀:1511
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 人巨細胞病毒是一種很常見的皰疹病毒,感染約50-100%的成人,但通常沒有不良影響,并且它可以保持潛伏多年。人巨細胞病毒感染是比較常見的,發展中國家感染人數比發達國家人數多。

該病毒可導致出新生兒生缺陷和免疫系統受損,可能會導致致命疾病。該病毒也與癌癥發展有關聯。這項新的研究分析了病毒的蛋白質組,并描述了所有表達的蛋白質。

研究人員認為,以往研究潛在編碼蛋白質的基因組很大程度上是計算機模型上的,這是不完整的。二十多年來,16個病毒株人巨細胞病毒基因組已被測序。

這是一個特別大的病毒基因組中,約240,000個堿基對。該小組開始研究感染HCMV的人成纖維細胞的核糖體。核糖體是細胞內制造蛋白質的細胞器。他們用質譜??分析以確定是否存在預測的蛋白質。

研究發現了數以百計的蛋白質編碼基因,這些基因此前未被確定在基因組中。編碼蛋白質的DNApian段被稱為開放閱讀框架,在基因組序列的分析基礎上,以前的研究預測有200幀。

了解病毒基因組表達的蛋白質可能有助于確定該病毒是如何影響宿主細胞的。相關研究論文發表在Science上,研究小組說核糖體分析技術和質譜相結合方法可用于研究其他復雜病毒的蛋白質組。

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