日常中經常會遇到液相色譜儀使用過程中冒出氣泡，一般是由于溫度上升，壓力下降造成的。
溫度上升或柱溫上升，當接近試劑沸點時，試劑汽化產生氣泡，試劑中已含微小氣泡，因加熱變大而產生氣泡。壓力下降產生氣泡，流動相中一直包含微小氣泡，無論超聲過濾，均不能池底去掉它，那么當壓力下降時，微小氣泡將長大，且多個小氣泡易聚集成大氣泡，而影響正常實驗。
氣泡產生原因分析處理：
1、 泵頭：泵頭是壓力變化zui劇烈的地方，也是zui易產生氣泡的地方，泵頭靠負壓而吸液，而負壓必然使流動相中的小氣泡長大，當泵腔變正壓時，已長大的氣泡未必能 全部變小流入后續液路，則泵腔內將積存氣泡，從而影響吸液精度，鑒于此，泵頭上專門設計了排氣閥，便于泵頭排氣，觀察柱壓穩定了說明泵頭排氣成功。
2、吸液白管長氣泡。
a、吸液白管接觸空氣部位漏氣，產生可見氣泡，吸液白管是常壓和負壓交臂變化部位，其漏表現為大氣進入白管內，而不易見到管內液體漏出。
處理方法：更換白管。
b、濾頭堵：濾頭堵使得液體流入濾頭的速度下降，泵強制吸液而產生真空氣泡。
判斷：拔掉濾頭不再長氣泡則是濾頭堵。
處理：A、30%硝酸水液超洗濾頭，20分鐘左右。
B、水超洗濾頭，注意換水多超幾次。
c、流動相汽化產生氣泡。
尤其是夏天室溫高，沸點低的試劑易汽化，比如：乙酸，乙mi，氨水，石油醚等易于汽化。
處理：超聲，降室溫。
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