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Yoon等（1992）報道用IFA檢測PRRSV抗體的方法，目前在北美應用較為廣泛，該方法與IPMA具有相同的特異性和敏感性。用IFA方法能從感染后6天的動物體內檢測出PRRS抗體，可用PAM、CL2621及MARC-145培養物進行IFA，并以血清抗體效價≥1：20作為陽性判斷的依據。

應用IFA檢測東北、華北、華中、華南等10個地區的10個豬場，豬場陽性率為40％（4／10），而4個陽性豬場的平均陽性率為58．5％（郭寶清等，1996）；張鶴曉等（1996）應用IFA檢測北京地區3個豬場的血清，陽性率為50％。由于該方法也需細胞培養和特殊顯微鏡觀察，檢測結果不能自動顯，檢測大量血清樣品受到限制，不適合大規模檢疫，并且其結果判定也有一定的主觀性，因此也未能廣泛應用。