價格 | 詢價 |
---|
什么是CUT&Tag?原理、步驟與優勢全解析檢測技術服務詳情介紹
目前,對染色質狀態的探索已經從ChIP-seq邁向更為靈敏和高效的新方法。其中,CUT&Tag技術因其高靈敏度、低背景噪音和高通量而迅速嶄露頭角,成為研究染色質表觀遺傳學領域的新寵。那么,什么是CUT&Tag?本文將為您詳細解析CUT&Tag技術的原理、步驟與優勢,并探討它如何推動生命科學研究的前沿進展。
一、什么是CUT&Tag?
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是高靈敏度的表觀遺傳分析技術,通過靶向染色質特異蛋白,jīngzhǔn地標記和剪切染色質區域,實現對組蛋白修飾和轉錄因子結合位點的高效分析。與ChIP-seq相比,CUT&Tag具有靈敏度高、背景噪音低、細胞用量少等突出優勢,特別適合稀有細胞群體或低起始材料的研究場景。目前,這項技術已被廣泛應用于腫瘤、免疫、發育生物學及神經科學研究領域。
二、CUT&Tag的原理及機制
CUT&Tag的核心機制基于染色質結合蛋白特異性抗體介導的染色質jīngzhǔn剪切和標記。其具體機制可概括為以下三個關鍵步驟:
1、特異性抗體識別結合靶蛋白
首先,將細胞或組織樣本輕微固定后透化,加入特異性抗體,與靶向的染色質相關蛋白(如組蛋白修飾、轉錄因子)結合。這一步確保了反應的jīngzhǔn性和特異性。
2、蛋白A/G-Tn5轉座酶偶聯復合物的招募
隨后加入偶聯有Tn5轉座酶的蛋白A或蛋白G融合蛋白,這些融合蛋白能夠特異性識別并結合抗體Fc區域,從而jīngzhǔn定位到目標蛋白結合位點附近的染色質區域。
3、Tn5轉座酶介導DNA剪切與標記
在Mg2?輔助下,Tn5轉座酶活化并實現染色質DNA片段的直接剪切,同時在剪切的位點引入接頭序列(Tag)。隨后,通過簡單的PCR擴增步驟即可完成文庫構建,并用于高通量測序。
三、CUT&Tag技術的實驗步驟詳解
CUT&Tag的實驗過程相較ChIP-seq更加簡便快捷,主要步驟如下:
1、細胞或組織樣本處理
(1)細胞收集,輕度固定或未固定。
(2)細胞透化,促進抗體進入核內染色質。
2、特異性抗體孵育
加入特異性抗體,通常在4℃孵育數小時至過夜,以確保充分結合。
3、蛋白A/G-Tn5復合物孵育
加入偶聯有Tn5的蛋白A/G復合物,孵育約1小時,使之jīngzhǔn定位于目標蛋白附近。
4、染色質片段化與標記
加入Mg2?激活Tn5酶,反應短至數分鐘即可完成DNA的剪切和標記。
5、DNA回收與PCR擴增
(1)直接釋放DNA片段,不需復雜的免疫沉淀和純化步驟。
(2)PCR擴增后進行高通量測序分析。
四、CUT&Tag的技術優勢與應用場景
1、優勢突出
(1)靈敏度更高:CUT&Tag的起始細胞數量可低至100-1000個,甚至適用于單細胞水平的分析。
(2)背景噪音低:無需免疫沉淀步驟,降低非特異性信號,獲得更加清晰的數據。
(3)操作便捷迅速:實驗周期短至1-2天,顯著提高研究效率。
2、應用廣泛
CUT&Tag的高通量、靈敏度和特異性使其廣泛適用于:
(1)稀有細胞群體的表觀遺傳研究(如干細胞或腫瘤干細胞)。
(2)jīngzhǔn繪制染色質修飾圖譜,研究疾病相關的表觀遺傳變化。
(3)單細胞水平的染色質分析,探索細胞異質性和動態調控過程。
五、CUT&Tag vs. ChIP-seq:選擇哪種技術?
雖然CUT&Tag憑借上述優勢逐漸成為表觀遺傳研究的重要工具,但在選擇CUT&Tag或ChIP-seq技術時,研究者仍需考慮具體實驗需求:
如果目標是低起始量樣本或需要快速、高靈敏度數據,CUT&Tag技術更有優勢;而面對更復雜蛋白靶標時,ChIP-seq或許更為穩妥。
CUT&Tag技術在蛋白組學和染色質表觀遺傳研究領域日益火熱,然而成功的實驗依賴于高品質的抗體、Tn5酶等試劑及優化的實驗流程。百泰派克生物科技為科研人員提供高質量的CUT&Tag相關試劑和解決方案,憑借自主研發的高純度抗體、jīngzhǔn的蛋白A/G-Tn5融合酶,以及完善的技術支持,助力科研人員輕松實現jīngzhǔn、高效的染色質研究。CUT&Tag以其yōuyuè的靈敏性和便捷性,正逐漸替代或補充ChIP-seq技術。隨著科研的深入,CUT&Tag勢必推動表觀遺傳學領域更多的科研突破。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術*,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合*藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!