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CY3-5TAMRA-YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS的分子結構

來源:西安瑞禧生物科技有限公司   2025年08月07日 15:48  

英文名稱:CY3-5TAMRA-YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
中文名稱:CY3-5TAMRA-酪氨酸-絲氨酸-脯氨酸-蘇氨酸-絲氨酸-脯氨酸-絲氨酸-酪氨酸-絲氨酸-脯氨酸-蘇氨酸-絲氨酸-脯氨酸-絲氨酸-酪氨酸-絲氨酸-脯氨酸-蘇氨酸-絲氨酸-脯氨酸-絲氨酸

分子結構與設計特點

CY3-5TAMRA-YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS是一種經過熒光標記修飾的多肽探針,具有特定的氨基酸序列與雙重熒光標記。其核心肽段“YSPTSPS”重復三次,是來源于真核RNA聚合酶II CTD(C端結構域,C-terminal domain)的典型七肽重復序列之一。該序列在多種生物調控過程中具有一定的結構或功能指示意義,常被用于研究轉錄調控、蛋白相互作用、磷酸化等生物過程。

在肽鏈兩端分別連接了兩種不同的熒光染料:CY3和5-TAMRA。其中,CY3是一種常用的綠色熒光染料,具有良好的水溶性和光穩定性,常用于熒光顯微成像和FRET實驗;5-TAMRA(5-羧基四甲基羅丹明)則發出橙紅色熒光,具有較高的熒光量子產率。這種雙重標記的設計為多通道熒光檢測和動態跟蹤提供了便利,能夠實現對多肽在細胞內外行為的實時監測。

應用背景與功能探討

CTD序列中的“YSPTSPS”在真核生物中廣泛存在,且易受絲氨酸殘基位點磷酸化調控。此類序列的重復形式常作為表征CTD修飾狀態的模型肽段。在CY3-5TAMRA-YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS中,這種重復為研究其序列在蛋白相互作用、酶促修飾等過程中的功能提供了模型基礎。

該探針在細胞生物學研究中可被用于熒光共定位、相互作用檢測、分子軌跡追蹤、以及FRET(熒光共振能量轉移)等實驗。通過利用兩個熒光染料間的空間接近性,可探討肽段構象變化或分子間的物理接觸。

標記方式與結構優勢

CY3和5-TAMRA分別標記在肽鏈的N末端與C末端,這種頭尾標記方式有助于研究肽鏈構象變化對染料之間距離的影響。同時,由于肽鏈本身為中性且富含親水性氨基酸,使得探針整體具有較好的水溶性,便于在水相或細胞環境中使用。

5-TAMRA為ROX類熒光染料,其激發和發射波長分別約為546 nm和579 nm,與CY3的激發(約550 nm)和發射(約570 nm)具有部分重疊,使得它們在FRET或多重成像系統中可以進行合理區分與聯用。

純度與質量控制

該多肽通常采用固相合成法(SPPS)進行制備,并經過HPLC純化與質譜檢測確認其分子量和標記位點的完整性。純度一般在95%以上,確保用于熒光成像或生化實驗時具備良好的信噪比與重復性。

儲存與使用建議

為保持其光學穩定性,建議將該多肽避光冷凍保存(-20℃以下),并避免多次反復凍融。溶解時推薦使用DMSO或含少量有機溶劑的緩沖體系,并根據具體實驗條件選擇適宜的濃度和體系。

CY3-5TAMRA-YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS

產地:西安瑞禧生物

用途:科研

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